Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQD0

SCN8A, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN8AQ9UQD0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCN8AQ9UQD0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN8AQ9UQD0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN8AQ9UQD0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN8AQ9UQD0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN8AQ9UQD0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN8AQ9UQD0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN8AQ9UQD0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN8AQ9UQD0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN8AQ9UQD0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN8AQ9UQD0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN8AQ9UQD0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN8AQ9UQD0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN8AQ9UQD0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN8AQ9UQD0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN8AQ9UQD0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN8AQ9UQD0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN8AQ9UQD0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN8AQ9UQD0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN8AQ9UQD0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN8AQ9UQD0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN8AQ9UQD0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN8AQ9UQD0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN8AQ9UQD0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN8AQ9UQD0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN8AQ9UQD0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN8AQ9UQD0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN8AQ9UQD0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN8AQ9UQD0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN8AQ9UQD0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN8AQ9UQD0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN8AQ9UQD0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN8AQ9UQD0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN8AQ9UQD0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN8AQ9UQD0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN8AQ9UQD0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN8AQ9UQD0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN8AQ9UQD0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN8AQ9UQD0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN8AQ9UQD0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN8AQ9UQD0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN8AQ9UQD0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN8AQ9UQD0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN8AQ9UQD0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN8AQ9UQD0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN8AQ9UQD0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN8AQ9UQD0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN8AQ9UQD0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN8AQ9UQD0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN8AQ9UQD0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN8AQ9UQD0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN8AQ9UQD0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN8AQ9UQD0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN8AQ9UQD0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN8AQ9UQD0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN8AQ9UQD0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN8AQ9UQD0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN8AQ9UQD0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN8AQ9UQD0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN8AQ9UQD0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN8AQ9UQD0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN8AQ9UQD0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN8AQ9UQD0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN8AQ9UQD0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN8AQ9UQD0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN8AQ9UQD0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN8AQ9UQD0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN8AQ9UQD0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN8AQ9UQD0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN8AQ9UQD0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN8AQ9UQD0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN8AQ9UQD0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN8AQ9UQD0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN8AQ9UQD0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN8AQ9UQD0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN8AQ9UQD0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN8AQ9UQD0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN8AQ9UQD0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN8AQ9UQD0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN8AQ9UQD0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN8AQ9UQD0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN8AQ9UQD0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN8AQ9UQD0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN8AQ9UQD0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN8AQ9UQD0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN8AQ9UQD0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN8AQ9UQD0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN8AQ9UQD0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN8AQ9UQD0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN8AQ9UQD0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN8AQ9UQD0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN8AQ9UQD0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN8AQ9UQD0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN8AQ9UQD0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN8AQ9UQD0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN8AQ9UQD0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN8AQ9UQD0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SCN8AQ9UQD0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCN8AQ9UQD0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCN8AQ9UQD0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms