Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPY8

MAPRE3, Microtubule-associated protein RP/EB family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPRE3Q9UPY8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAPRE3Q9UPY8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAPRE3Q9UPY8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAPRE3Q9UPY8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAPRE3Q9UPY8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAPRE3Q9UPY8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MAPRE3Q9UPY8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAPRE3Q9UPY8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAPRE3Q9UPY8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAPRE3Q9UPY8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAPRE3Q9UPY8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAPRE3Q9UPY8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAPRE3Q9UPY8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAPRE3Q9UPY8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAPRE3Q9UPY8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAPRE3Q9UPY8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAPRE3Q9UPY8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAPRE3Q9UPY8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAPRE3Q9UPY8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAPRE3Q9UPY8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAPRE3Q9UPY8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAPRE3Q9UPY8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAPRE3Q9UPY8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAPRE3Q9UPY8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAPRE3Q9UPY8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAPRE3Q9UPY8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAPRE3Q9UPY8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAPRE3Q9UPY8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAPRE3Q9UPY8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAPRE3Q9UPY8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAPRE3Q9UPY8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAPRE3Q9UPY8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAPRE3Q9UPY8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAPRE3Q9UPY8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAPRE3Q9UPY8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAPRE3Q9UPY8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAPRE3Q9UPY8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAPRE3Q9UPY8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAPRE3Q9UPY8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAPRE3Q9UPY8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAPRE3Q9UPY8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MAPRE3Q9UPY8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MAPRE3Q9UPY8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAPRE3Q9UPY8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAPRE3Q9UPY8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MAPRE3Q9UPY8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAPRE3Q9UPY8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAPRE3Q9UPY8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAPRE3Q9UPY8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAPRE3Q9UPY8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAPRE3Q9UPY8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAPRE3Q9UPY8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAPRE3Q9UPY8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAPRE3Q9UPY8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAPRE3Q9UPY8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAPRE3Q9UPY8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAPRE3Q9UPY8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAPRE3Q9UPY8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAPRE3Q9UPY8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAPRE3Q9UPY8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAPRE3Q9UPY8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MAPRE3Q9UPY8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAPRE3Q9UPY8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAPRE3Q9UPY8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAPRE3Q9UPY8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MAPRE3Q9UPY8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MAPRE3Q9UPY8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAPRE3Q9UPY8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MAPRE3Q9UPY8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAPRE3Q9UPY8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAPRE3Q9UPY8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAPRE3Q9UPY8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAPRE3Q9UPY8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAPRE3Q9UPY8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAPRE3Q9UPY8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAPRE3Q9UPY8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAPRE3Q9UPY8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAPRE3Q9UPY8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAPRE3Q9UPY8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAPRE3Q9UPY8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAPRE3Q9UPY8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAPRE3Q9UPY8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAPRE3Q9UPY8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAPRE3Q9UPY8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAPRE3Q9UPY8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAPRE3Q9UPY8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MAPRE3Q9UPY8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAPRE3Q9UPY8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAPRE3Q9UPY8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAPRE3Q9UPY8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAPRE3Q9UPY8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MAPRE3Q9UPY8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAPRE3Q9UPY8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAPRE3Q9UPY8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAPRE3Q9UPY8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAPRE3Q9UPY8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAPRE3Q9UPY8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAPRE3Q9UPY8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAPRE3Q9UPY8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAPRE3Q9UPY8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms