Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX6Q9UNH7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX6Q9UNH7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX6Q9UNH7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX6Q9UNH7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX6Q9UNH7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX6Q9UNH7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX6Q9UNH7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX6Q9UNH7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX6Q9UNH7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX6Q9UNH7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX6Q9UNH7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX6Q9UNH7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX6Q9UNH7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX6Q9UNH7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX6Q9UNH7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX6Q9UNH7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX6Q9UNH7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX6Q9UNH7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX6Q9UNH7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX6Q9UNH7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX6Q9UNH7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX6Q9UNH7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX6Q9UNH7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX6Q9UNH7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX6Q9UNH7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX6Q9UNH7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX6Q9UNH7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX6Q9UNH7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX6Q9UNH7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX6Q9UNH7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX6Q9UNH7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX6Q9UNH7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX6Q9UNH7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX6Q9UNH7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX6Q9UNH7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX6Q9UNH7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX6Q9UNH7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX6Q9UNH7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX6Q9UNH7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX6Q9UNH7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX6Q9UNH7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX6Q9UNH7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX6Q9UNH7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX6Q9UNH7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX6Q9UNH7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX6Q9UNH7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX6Q9UNH7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX6Q9UNH7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX6Q9UNH7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX6Q9UNH7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX6Q9UNH7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX6Q9UNH7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX6Q9UNH7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX6Q9UNH7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX6Q9UNH7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX6Q9UNH7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX6Q9UNH7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX6Q9UNH7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX6Q9UNH7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX6Q9UNH7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX6Q9UNH7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX6Q9UNH7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX6Q9UNH7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX6Q9UNH7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX6Q9UNH7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX6Q9UNH7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX6Q9UNH7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX6Q9UNH7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX6Q9UNH7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX6Q9UNH7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX6Q9UNH7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX6Q9UNH7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX6Q9UNH7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX6Q9UNH7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX6Q9UNH7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX6Q9UNH7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX6Q9UNH7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX6Q9UNH7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX6Q9UNH7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX6Q9UNH7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX6Q9UNH7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX6Q9UNH7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX6Q9UNH7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX6Q9UNH7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX6Q9UNH7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX6Q9UNH7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX6Q9UNH7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX6Q9UNH7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX6Q9UNH7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX6Q9UNH7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX6Q9UNH7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX6Q9UNH7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX6Q9UNH7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX6Q9UNH7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX6Q9UNH7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX6Q9UNH7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX6Q9UNH7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX6Q9UNH7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX6Q9UNH7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms