Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNE0

EDAR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member EDAR, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDARQ9UNE0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EDARQ9UNE0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EDARQ9UNE0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EDARQ9UNE0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EDARQ9UNE0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EDARQ9UNE0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
EDARQ9UNE0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EDARQ9UNE0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EDARQ9UNE0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EDARQ9UNE0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EDARQ9UNE0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EDARQ9UNE0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EDARQ9UNE0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EDARQ9UNE0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EDARQ9UNE0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EDARQ9UNE0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EDARQ9UNE0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EDARQ9UNE0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EDARQ9UNE0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EDARQ9UNE0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EDARQ9UNE0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EDARQ9UNE0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EDARQ9UNE0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EDARQ9UNE0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EDARQ9UNE0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
EDARQ9UNE0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
EDARQ9UNE0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EDARQ9UNE0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EDARQ9UNE0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EDARQ9UNE0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EDARQ9UNE0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EDARQ9UNE0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EDARQ9UNE0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EDARQ9UNE0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EDARQ9UNE0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
EDARQ9UNE0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
EDARQ9UNE0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EDARQ9UNE0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EDARQ9UNE0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EDARQ9UNE0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EDARQ9UNE0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EDARQ9UNE0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EDARQ9UNE0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EDARQ9UNE0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EDARQ9UNE0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EDARQ9UNE0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EDARQ9UNE0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EDARQ9UNE0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EDARQ9UNE0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EDARQ9UNE0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EDARQ9UNE0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EDARQ9UNE0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EDARQ9UNE0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EDARQ9UNE0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDARQ9UNE0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
EDARQ9UNE0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDARQ9UNE0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDARQ9UNE0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDARQ9UNE0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDARQ9UNE0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDARQ9UNE0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDARQ9UNE0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDARQ9UNE0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EDARQ9UNE0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EDARQ9UNE0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EDARQ9UNE0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EDARQ9UNE0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EDARQ9UNE0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EDARQ9UNE0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EDARQ9UNE0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EDARQ9UNE0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EDARQ9UNE0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EDARQ9UNE0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDARQ9UNE0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDARQ9UNE0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDARQ9UNE0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDARQ9UNE0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
EDARQ9UNE0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDARQ9UNE0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDARQ9UNE0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDARQ9UNE0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDARQ9UNE0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDARQ9UNE0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDARQ9UNE0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDARQ9UNE0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDARQ9UNE0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDARQ9UNE0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDARQ9UNE0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EDARQ9UNE0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EDARQ9UNE0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EDARQ9UNE0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EDARQ9UNE0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
EDARQ9UNE0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
EDARQ9UNE0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EDARQ9UNE0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDARQ9UNE0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDARQ9UNE0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
EDARQ9UNE0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDARQ9UNE0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
EDARQ9UNE0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms