Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX12Q9UMY4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX12Q9UMY4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX12Q9UMY4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX12Q9UMY4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX12Q9UMY4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX12Q9UMY4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX12Q9UMY4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX12Q9UMY4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX12Q9UMY4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX12Q9UMY4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX12Q9UMY4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX12Q9UMY4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX12Q9UMY4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX12Q9UMY4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX12Q9UMY4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX12Q9UMY4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX12Q9UMY4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX12Q9UMY4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX12Q9UMY4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX12Q9UMY4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX12Q9UMY4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX12Q9UMY4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX12Q9UMY4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX12Q9UMY4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX12Q9UMY4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX12Q9UMY4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX12Q9UMY4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX12Q9UMY4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX12Q9UMY4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX12Q9UMY4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX12Q9UMY4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX12Q9UMY4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX12Q9UMY4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX12Q9UMY4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX12Q9UMY4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX12Q9UMY4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX12Q9UMY4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX12Q9UMY4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX12Q9UMY4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX12Q9UMY4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX12Q9UMY4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX12Q9UMY4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX12Q9UMY4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX12Q9UMY4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX12Q9UMY4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX12Q9UMY4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX12Q9UMY4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX12Q9UMY4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX12Q9UMY4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX12Q9UMY4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX12Q9UMY4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX12Q9UMY4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX12Q9UMY4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX12Q9UMY4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX12Q9UMY4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX12Q9UMY4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX12Q9UMY4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX12Q9UMY4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX12Q9UMY4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX12Q9UMY4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX12Q9UMY4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX12Q9UMY4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX12Q9UMY4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX12Q9UMY4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX12Q9UMY4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX12Q9UMY4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX12Q9UMY4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX12Q9UMY4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX12Q9UMY4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX12Q9UMY4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX12Q9UMY4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX12Q9UMY4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX12Q9UMY4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX12Q9UMY4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX12Q9UMY4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX12Q9UMY4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX12Q9UMY4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX12Q9UMY4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX12Q9UMY4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX12Q9UMY4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX12Q9UMY4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX12Q9UMY4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX12Q9UMY4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX12Q9UMY4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX12Q9UMY4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX12Q9UMY4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX12Q9UMY4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX12Q9UMY4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX12Q9UMY4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX12Q9UMY4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX12Q9UMY4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX12Q9UMY4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX12Q9UMY4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX12Q9UMY4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX12Q9UMY4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX12Q9UMY4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX12Q9UMY4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX12Q9UMY4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX12Q9UMY4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms