Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNRF3Q9ULT6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNRF3Q9ULT6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNRF3Q9ULT6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZNRF3Q9ULT6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZNRF3Q9ULT6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZNRF3Q9ULT6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZNRF3Q9ULT6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZNRF3Q9ULT6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZNRF3Q9ULT6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZNRF3Q9ULT6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZNRF3Q9ULT6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZNRF3Q9ULT6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNRF3Q9ULT6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNRF3Q9ULT6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNRF3Q9ULT6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNRF3Q9ULT6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNRF3Q9ULT6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNRF3Q9ULT6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNRF3Q9ULT6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNRF3Q9ULT6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNRF3Q9ULT6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNRF3Q9ULT6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNRF3Q9ULT6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNRF3Q9ULT6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNRF3Q9ULT6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNRF3Q9ULT6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNRF3Q9ULT6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNRF3Q9ULT6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ZNRF3Q9ULT6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ZNRF3Q9ULT6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZNRF3Q9ULT6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZNRF3Q9ULT6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZNRF3Q9ULT6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZNRF3Q9ULT6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZNRF3Q9ULT6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNRF3Q9ULT6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNRF3Q9ULT6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNRF3Q9ULT6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNRF3Q9ULT6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZNRF3Q9ULT6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZNRF3Q9ULT6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZNRF3Q9ULT6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZNRF3Q9ULT6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNRF3Q9ULT6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNRF3Q9ULT6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNRF3Q9ULT6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNRF3Q9ULT6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNRF3Q9ULT6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNRF3Q9ULT6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZNRF3Q9ULT6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZNRF3Q9ULT6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZNRF3Q9ULT6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ZNRF3Q9ULT6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZNRF3Q9ULT6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNRF3Q9ULT6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNRF3Q9ULT6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNRF3Q9ULT6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNRF3Q9ULT6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNRF3Q9ULT6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNRF3Q9ULT6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNRF3Q9ULT6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNRF3Q9ULT6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNRF3Q9ULT6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNRF3Q9ULT6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ZNRF3Q9ULT6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNRF3Q9ULT6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNRF3Q9ULT6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNRF3Q9ULT6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNRF3Q9ULT6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNRF3Q9ULT6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNRF3Q9ULT6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNRF3Q9ULT6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNRF3Q9ULT6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNRF3Q9ULT6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNRF3Q9ULT6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNRF3Q9ULT6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNRF3Q9ULT6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNRF3Q9ULT6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNRF3Q9ULT6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNRF3Q9ULT6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNRF3Q9ULT6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNRF3Q9ULT6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNRF3Q9ULT6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNRF3Q9ULT6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNRF3Q9ULT6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNRF3Q9ULT6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNRF3Q9ULT6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNRF3Q9ULT6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNRF3Q9ULT6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNRF3Q9ULT6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNRF3Q9ULT6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNRF3Q9ULT6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNRF3Q9ULT6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNRF3Q9ULT6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNRF3Q9ULT6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNRF3Q9ULT6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNRF3Q9ULT6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNRF3Q9ULT6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNRF3Q9ULT6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms