Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM2

ZNF490, Zinc finger protein 490, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF490Q9ULM2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF490Q9ULM2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF490Q9ULM2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF490Q9ULM2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF490Q9ULM2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF490Q9ULM2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF490Q9ULM2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF490Q9ULM2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF490Q9ULM2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF490Q9ULM2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF490Q9ULM2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF490Q9ULM2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF490Q9ULM2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF490Q9ULM2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF490Q9ULM2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF490Q9ULM2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF490Q9ULM2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF490Q9ULM2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF490Q9ULM2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF490Q9ULM2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF490Q9ULM2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF490Q9ULM2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF490Q9ULM2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF490Q9ULM2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF490Q9ULM2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF490Q9ULM2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF490Q9ULM2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF490Q9ULM2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF490Q9ULM2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF490Q9ULM2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF490Q9ULM2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF490Q9ULM2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF490Q9ULM2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF490Q9ULM2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF490Q9ULM2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF490Q9ULM2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF490Q9ULM2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF490Q9ULM2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF490Q9ULM2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF490Q9ULM2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF490Q9ULM2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF490Q9ULM2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF490Q9ULM2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF490Q9ULM2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF490Q9ULM2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF490Q9ULM2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF490Q9ULM2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF490Q9ULM2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF490Q9ULM2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF490Q9ULM2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF490Q9ULM2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF490Q9ULM2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF490Q9ULM2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF490Q9ULM2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF490Q9ULM2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF490Q9ULM2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF490Q9ULM2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF490Q9ULM2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF490Q9ULM2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF490Q9ULM2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF490Q9ULM2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF490Q9ULM2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF490Q9ULM2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF490Q9ULM2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF490Q9ULM2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF490Q9ULM2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF490Q9ULM2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF490Q9ULM2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF490Q9ULM2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF490Q9ULM2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF490Q9ULM2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF490Q9ULM2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF490Q9ULM2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF490Q9ULM2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF490Q9ULM2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF490Q9ULM2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF490Q9ULM2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF490Q9ULM2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF490Q9ULM2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF490Q9ULM2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF490Q9ULM2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF490Q9ULM2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF490Q9ULM2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF490Q9ULM2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF490Q9ULM2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF490Q9ULM2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF490Q9ULM2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF490Q9ULM2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF490Q9ULM2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF490Q9ULM2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF490Q9ULM2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF490Q9ULM2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF490Q9ULM2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF490Q9ULM2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF490Q9ULM2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF490Q9ULM2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF490Q9ULM2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF490Q9ULM2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF490Q9ULM2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ZNF490Q9ULM2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms