Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKP3

ITGB1BP2, Integrin beta-1-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB1BP2Q9UKP3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB1BP2Q9UKP3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB1BP2Q9UKP3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB1BP2Q9UKP3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB1BP2Q9UKP3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB1BP2Q9UKP3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB1BP2Q9UKP3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB1BP2Q9UKP3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB1BP2Q9UKP3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB1BP2Q9UKP3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB1BP2Q9UKP3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB1BP2Q9UKP3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB1BP2Q9UKP3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB1BP2Q9UKP3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB1BP2Q9UKP3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB1BP2Q9UKP3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB1BP2Q9UKP3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB1BP2Q9UKP3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB1BP2Q9UKP3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ITGB1BP2Q9UKP3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ITGB1BP2Q9UKP3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB1BP2Q9UKP3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB1BP2Q9UKP3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB1BP2Q9UKP3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB1BP2Q9UKP3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB1BP2Q9UKP3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB1BP2Q9UKP3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB1BP2Q9UKP3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB1BP2Q9UKP3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB1BP2Q9UKP3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB1BP2Q9UKP3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB1BP2Q9UKP3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.4 ms