Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MRTO4Q9UKD2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MRTO4Q9UKD2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRTO4Q9UKD2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRTO4Q9UKD2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRTO4Q9UKD2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRTO4Q9UKD2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRTO4Q9UKD2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRTO4Q9UKD2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRTO4Q9UKD2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRTO4Q9UKD2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRTO4Q9UKD2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRTO4Q9UKD2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MRTO4Q9UKD2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MRTO4Q9UKD2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRTO4Q9UKD2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRTO4Q9UKD2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRTO4Q9UKD2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRTO4Q9UKD2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRTO4Q9UKD2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRTO4Q9UKD2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRTO4Q9UKD2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRTO4Q9UKD2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRTO4Q9UKD2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRTO4Q9UKD2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRTO4Q9UKD2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRTO4Q9UKD2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRTO4Q9UKD2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRTO4Q9UKD2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRTO4Q9UKD2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRTO4Q9UKD2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRTO4Q9UKD2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRTO4Q9UKD2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRTO4Q9UKD2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRTO4Q9UKD2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRTO4Q9UKD2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRTO4Q9UKD2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRTO4Q9UKD2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRTO4Q9UKD2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRTO4Q9UKD2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRTO4Q9UKD2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRTO4Q9UKD2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MRTO4Q9UKD2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRTO4Q9UKD2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRTO4Q9UKD2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms