Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TUBE1Q9UJT0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TUBE1Q9UJT0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TUBE1Q9UJT0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TUBE1Q9UJT0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TUBE1Q9UJT0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TUBE1Q9UJT0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TUBE1Q9UJT0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TUBE1Q9UJT0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TUBE1Q9UJT0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TUBE1Q9UJT0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TUBE1Q9UJT0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TUBE1Q9UJT0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TUBE1Q9UJT0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TUBE1Q9UJT0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TUBE1Q9UJT0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TUBE1Q9UJT0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TUBE1Q9UJT0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TUBE1Q9UJT0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TUBE1Q9UJT0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TUBE1Q9UJT0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TUBE1Q9UJT0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TUBE1Q9UJT0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUBE1Q9UJT0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUBE1Q9UJT0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUBE1Q9UJT0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUBE1Q9UJT0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUBE1Q9UJT0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUBE1Q9UJT0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUBE1Q9UJT0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUBE1Q9UJT0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUBE1Q9UJT0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUBE1Q9UJT0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUBE1Q9UJT0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUBE1Q9UJT0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUBE1Q9UJT0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TUBE1Q9UJT0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TUBE1Q9UJT0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TUBE1Q9UJT0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TUBE1Q9UJT0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TUBE1Q9UJT0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TUBE1Q9UJT0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TUBE1Q9UJT0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TUBE1Q9UJT0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TUBE1Q9UJT0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TUBE1Q9UJT0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TUBE1Q9UJT0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TUBE1Q9UJT0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TUBE1Q9UJT0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TUBE1Q9UJT0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TUBE1Q9UJT0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TUBE1Q9UJT0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TUBE1Q9UJT0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TUBE1Q9UJT0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TUBE1Q9UJT0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TUBE1Q9UJT0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TUBE1Q9UJT0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TUBE1Q9UJT0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TUBE1Q9UJT0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TUBE1Q9UJT0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TUBE1Q9UJT0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TUBE1Q9UJT0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TUBE1Q9UJT0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TUBE1Q9UJT0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TUBE1Q9UJT0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TUBE1Q9UJT0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TUBE1Q9UJT0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TUBE1Q9UJT0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TUBE1Q9UJT0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TUBE1Q9UJT0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TUBE1Q9UJT0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TUBE1Q9UJT0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TUBE1Q9UJT0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TUBE1Q9UJT0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TUBE1Q9UJT0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TUBE1Q9UJT0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TUBE1Q9UJT0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TUBE1Q9UJT0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TUBE1Q9UJT0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TUBE1Q9UJT0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TUBE1Q9UJT0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TUBE1Q9UJT0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TUBE1Q9UJT0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TUBE1Q9UJT0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TUBE1Q9UJT0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TUBE1Q9UJT0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TUBE1Q9UJT0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TUBE1Q9UJT0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TUBE1Q9UJT0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TUBE1Q9UJT0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TUBE1Q9UJT0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TUBE1Q9UJT0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TUBE1Q9UJT0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TUBE1Q9UJT0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TUBE1Q9UJT0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TUBE1Q9UJT0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TUBE1Q9UJT0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TUBE1Q9UJT0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TUBE1Q9UJT0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TUBE1Q9UJT0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms