Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHF7

TRPS1, Zinc finger transcription factor Trps1, humanhuman

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1Q9UHF7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRPS1Q9UHF7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRPS1Q9UHF7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRPS1Q9UHF7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRPS1Q9UHF7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRPS1Q9UHF7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRPS1Q9UHF7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRPS1Q9UHF7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRPS1Q9UHF7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRPS1Q9UHF7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRPS1Q9UHF7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRPS1Q9UHF7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRPS1Q9UHF7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRPS1Q9UHF7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRPS1Q9UHF7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRPS1Q9UHF7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRPS1Q9UHF7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRPS1Q9UHF7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRPS1Q9UHF7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRPS1Q9UHF7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRPS1Q9UHF7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRPS1Q9UHF7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRPS1Q9UHF7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRPS1Q9UHF7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRPS1Q9UHF7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRPS1Q9UHF7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRPS1Q9UHF7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRPS1Q9UHF7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRPS1Q9UHF7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRPS1Q9UHF7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRPS1Q9UHF7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRPS1Q9UHF7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRPS1Q9UHF7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRPS1Q9UHF7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRPS1Q9UHF7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRPS1Q9UHF7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRPS1Q9UHF7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRPS1Q9UHF7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRPS1Q9UHF7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRPS1Q9UHF7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRPS1Q9UHF7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRPS1Q9UHF7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRPS1Q9UHF7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRPS1Q9UHF7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRPS1Q9UHF7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRPS1Q9UHF7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRPS1Q9UHF7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRPS1Q9UHF7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRPS1Q9UHF7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRPS1Q9UHF7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRPS1Q9UHF7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRPS1Q9UHF7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRPS1Q9UHF7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRPS1Q9UHF7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRPS1Q9UHF7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRPS1Q9UHF7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRPS1Q9UHF7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRPS1Q9UHF7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRPS1Q9UHF7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRPS1Q9UHF7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRPS1Q9UHF7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRPS1Q9UHF7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRPS1Q9UHF7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRPS1Q9UHF7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRPS1Q9UHF7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRPS1Q9UHF7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRPS1Q9UHF7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRPS1Q9UHF7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRPS1Q9UHF7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRPS1Q9UHF7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRPS1Q9UHF7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRPS1Q9UHF7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRPS1Q9UHF7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRPS1Q9UHF7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRPS1Q9UHF7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
TRPS1Q9UHF7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRPS1Q9UHF7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRPS1Q9UHF7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRPS1Q9UHF7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRPS1Q9UHF7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRPS1Q9UHF7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRPS1Q9UHF7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRPS1Q9UHF7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRPS1Q9UHF7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRPS1Q9UHF7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRPS1Q9UHF7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRPS1Q9UHF7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRPS1Q9UHF7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRPS1Q9UHF7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRPS1Q9UHF7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRPS1Q9UHF7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRPS1Q9UHF7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRPS1Q9UHF7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRPS1Q9UHF7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRPS1Q9UHF7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRPS1Q9UHF7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRPS1Q9UHF7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRPS1Q9UHF7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPS1Q9UHF7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPS1Q9UHF7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms