Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM4

OPTC, Opticin, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTCQ9UBM4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OPTCQ9UBM4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OPTCQ9UBM4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OPTCQ9UBM4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OPTCQ9UBM4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OPTCQ9UBM4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OPTCQ9UBM4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OPTCQ9UBM4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OPTCQ9UBM4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
OPTCQ9UBM4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OPTCQ9UBM4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OPTCQ9UBM4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OPTCQ9UBM4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OPTCQ9UBM4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OPTCQ9UBM4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OPTCQ9UBM4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OPTCQ9UBM4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
OPTCQ9UBM4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OPTCQ9UBM4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OPTCQ9UBM4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OPTCQ9UBM4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OPTCQ9UBM4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OPTCQ9UBM4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OPTCQ9UBM4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OPTCQ9UBM4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
OPTCQ9UBM4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OPTCQ9UBM4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OPTCQ9UBM4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OPTCQ9UBM4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OPTCQ9UBM4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OPTCQ9UBM4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OPTCQ9UBM4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OPTCQ9UBM4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OPTCQ9UBM4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OPTCQ9UBM4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OPTCQ9UBM4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OPTCQ9UBM4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OPTCQ9UBM4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OPTCQ9UBM4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OPTCQ9UBM4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OPTCQ9UBM4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OPTCQ9UBM4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OPTCQ9UBM4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OPTCQ9UBM4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OPTCQ9UBM4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OPTCQ9UBM4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OPTCQ9UBM4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
OPTCQ9UBM4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OPTCQ9UBM4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OPTCQ9UBM4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OPTCQ9UBM4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OPTCQ9UBM4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OPTCQ9UBM4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OPTCQ9UBM4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
OPTCQ9UBM4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OPTCQ9UBM4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OPTCQ9UBM4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OPTCQ9UBM4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OPTCQ9UBM4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OPTCQ9UBM4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OPTCQ9UBM4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OPTCQ9UBM4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OPTCQ9UBM4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OPTCQ9UBM4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OPTCQ9UBM4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OPTCQ9UBM4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OPTCQ9UBM4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OPTCQ9UBM4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OPTCQ9UBM4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
OPTCQ9UBM4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
OPTCQ9UBM4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
OPTCQ9UBM4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OPTCQ9UBM4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OPTCQ9UBM4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OPTCQ9UBM4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OPTCQ9UBM4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OPTCQ9UBM4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
OPTCQ9UBM4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OPTCQ9UBM4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OPTCQ9UBM4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OPTCQ9UBM4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OPTCQ9UBM4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OPTCQ9UBM4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OPTCQ9UBM4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OPTCQ9UBM4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OPTCQ9UBM4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
OPTCQ9UBM4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OPTCQ9UBM4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OPTCQ9UBM4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
OPTCQ9UBM4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OPTCQ9UBM4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OPTCQ9UBM4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OPTCQ9UBM4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OPTCQ9UBM4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
OPTCQ9UBM4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
OPTCQ9UBM4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OPTCQ9UBM4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OPTCQ9UBM4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OPTCQ9UBM4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OPTCQ9UBM4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms