Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE8

NLK, Serine/threonine-protein kinase NLK, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLKQ9UBE8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NLKQ9UBE8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NLKQ9UBE8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NLKQ9UBE8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NLKQ9UBE8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NLKQ9UBE8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NLKQ9UBE8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NLKQ9UBE8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NLKQ9UBE8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NLKQ9UBE8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NLKQ9UBE8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NLKQ9UBE8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NLKQ9UBE8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NLKQ9UBE8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NLKQ9UBE8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NLKQ9UBE8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NLKQ9UBE8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NLKQ9UBE8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NLKQ9UBE8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NLKQ9UBE8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NLKQ9UBE8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NLKQ9UBE8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NLKQ9UBE8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NLKQ9UBE8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NLKQ9UBE8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NLKQ9UBE8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NLKQ9UBE8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NLKQ9UBE8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NLKQ9UBE8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NLKQ9UBE8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NLKQ9UBE8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NLKQ9UBE8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NLKQ9UBE8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NLKQ9UBE8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NLKQ9UBE8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NLKQ9UBE8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NLKQ9UBE8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NLKQ9UBE8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NLKQ9UBE8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NLKQ9UBE8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NLKQ9UBE8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NLKQ9UBE8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NLKQ9UBE8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NLKQ9UBE8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NLKQ9UBE8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLKQ9UBE8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLKQ9UBE8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLKQ9UBE8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLKQ9UBE8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLKQ9UBE8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLKQ9UBE8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLKQ9UBE8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLKQ9UBE8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLKQ9UBE8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLKQ9UBE8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLKQ9UBE8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLKQ9UBE8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLKQ9UBE8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLKQ9UBE8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLKQ9UBE8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NLKQ9UBE8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLKQ9UBE8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLKQ9UBE8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLKQ9UBE8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLKQ9UBE8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLKQ9UBE8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLKQ9UBE8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLKQ9UBE8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLKQ9UBE8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLKQ9UBE8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NLKQ9UBE8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLKQ9UBE8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLKQ9UBE8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLKQ9UBE8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLKQ9UBE8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLKQ9UBE8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLKQ9UBE8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLKQ9UBE8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLKQ9UBE8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLKQ9UBE8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLKQ9UBE8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLKQ9UBE8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLKQ9UBE8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLKQ9UBE8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLKQ9UBE8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLKQ9UBE8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLKQ9UBE8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLKQ9UBE8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLKQ9UBE8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NLKQ9UBE8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLKQ9UBE8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLKQ9UBE8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLKQ9UBE8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLKQ9UBE8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLKQ9UBE8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLKQ9UBE8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLKQ9UBE8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLKQ9UBE8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLKQ9UBE8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLKQ9UBE8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms