Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2W1

PSMC3IP, Homologous-pairing protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC3IPQ9P2W1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMC3IPQ9P2W1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMC3IPQ9P2W1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMC3IPQ9P2W1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMC3IPQ9P2W1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMC3IPQ9P2W1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMC3IPQ9P2W1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMC3IPQ9P2W1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMC3IPQ9P2W1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMC3IPQ9P2W1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMC3IPQ9P2W1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMC3IPQ9P2W1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMC3IPQ9P2W1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMC3IPQ9P2W1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMC3IPQ9P2W1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMC3IPQ9P2W1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMC3IPQ9P2W1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMC3IPQ9P2W1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMC3IPQ9P2W1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMC3IPQ9P2W1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMC3IPQ9P2W1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMC3IPQ9P2W1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMC3IPQ9P2W1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMC3IPQ9P2W1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMC3IPQ9P2W1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMC3IPQ9P2W1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMC3IPQ9P2W1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMC3IPQ9P2W1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMC3IPQ9P2W1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PSMC3IPQ9P2W1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMC3IPQ9P2W1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMC3IPQ9P2W1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMC3IPQ9P2W1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMC3IPQ9P2W1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMC3IPQ9P2W1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMC3IPQ9P2W1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMC3IPQ9P2W1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMC3IPQ9P2W1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMC3IPQ9P2W1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMC3IPQ9P2W1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMC3IPQ9P2W1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMC3IPQ9P2W1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMC3IPQ9P2W1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMC3IPQ9P2W1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMC3IPQ9P2W1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMC3IPQ9P2W1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMC3IPQ9P2W1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMC3IPQ9P2W1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMC3IPQ9P2W1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMC3IPQ9P2W1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMC3IPQ9P2W1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMC3IPQ9P2W1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMC3IPQ9P2W1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMC3IPQ9P2W1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMC3IPQ9P2W1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMC3IPQ9P2W1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMC3IPQ9P2W1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMC3IPQ9P2W1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMC3IPQ9P2W1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMC3IPQ9P2W1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMC3IPQ9P2W1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMC3IPQ9P2W1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMC3IPQ9P2W1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMC3IPQ9P2W1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMC3IPQ9P2W1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMC3IPQ9P2W1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMC3IPQ9P2W1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMC3IPQ9P2W1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMC3IPQ9P2W1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMC3IPQ9P2W1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMC3IPQ9P2W1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMC3IPQ9P2W1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMC3IPQ9P2W1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMC3IPQ9P2W1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMC3IPQ9P2W1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMC3IPQ9P2W1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMC3IPQ9P2W1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMC3IPQ9P2W1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMC3IPQ9P2W1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMC3IPQ9P2W1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMC3IPQ9P2W1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PSMC3IPQ9P2W1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMC3IPQ9P2W1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMC3IPQ9P2W1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMC3IPQ9P2W1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMC3IPQ9P2W1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMC3IPQ9P2W1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMC3IPQ9P2W1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMC3IPQ9P2W1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMC3IPQ9P2W1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMC3IPQ9P2W1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMC3IPQ9P2W1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMC3IPQ9P2W1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMC3IPQ9P2W1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMC3IPQ9P2W1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMC3IPQ9P2W1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMC3IPQ9P2W1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMC3IPQ9P2W1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMC3IPQ9P2W1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMC3IPQ9P2W1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms