Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
REREQ9P2R6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
REREQ9P2R6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
REREQ9P2R6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
REREQ9P2R6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
REREQ9P2R6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
REREQ9P2R6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
REREQ9P2R6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
REREQ9P2R6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
REREQ9P2R6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
REREQ9P2R6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
REREQ9P2R6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
REREQ9P2R6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
REREQ9P2R6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
REREQ9P2R6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
REREQ9P2R6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
REREQ9P2R6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC35.05■■■■□ 3.2
REREQ9P2R6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
REREQ9P2R6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
REREQ9P2R6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
REREQ9P2R6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
REREQ9P2R6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
REREQ9P2R6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
REREQ9P2R6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
REREQ9P2R6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
REREQ9P2R6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
REREQ9P2R6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
REREQ9P2R6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
REREQ9P2R6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
REREQ9P2R6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
REREQ9P2R6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
REREQ9P2R6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
REREQ9P2R6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
REREQ9P2R6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
REREQ9P2R6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
REREQ9P2R6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
REREQ9P2R6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
REREQ9P2R6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
REREQ9P2R6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
REREQ9P2R6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
REREQ9P2R6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC35■■■■□ 3.19
REREQ9P2R6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
REREQ9P2R6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
REREQ9P2R6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
REREQ9P2R6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC35■■■■□ 3.19
REREQ9P2R6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
REREQ9P2R6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
REREQ9P2R6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
REREQ9P2R6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
REREQ9P2R6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC34.98■■■■□ 3.19
REREQ9P2R6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
REREQ9P2R6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
REREQ9P2R6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC34.98■■■■□ 3.19
REREQ9P2R6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
REREQ9P2R6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
REREQ9P2R6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
REREQ9P2R6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
REREQ9P2R6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
REREQ9P2R6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC34.96■■■■□ 3.19
REREQ9P2R6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
REREQ9P2R6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
REREQ9P2R6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
REREQ9P2R6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
REREQ9P2R6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
REREQ9P2R6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.18
REREQ9P2R6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
REREQ9P2R6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC34.95■■■■□ 3.18
REREQ9P2R6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
REREQ9P2R6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
REREQ9P2R6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
REREQ9P2R6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
REREQ9P2R6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
REREQ9P2R6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
REREQ9P2R6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
REREQ9P2R6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
REREQ9P2R6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
REREQ9P2R6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
REREQ9P2R6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
REREQ9P2R6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
REREQ9P2R6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
REREQ9P2R6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
REREQ9P2R6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
REREQ9P2R6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
REREQ9P2R6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
REREQ9P2R6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
REREQ9P2R6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
REREQ9P2R6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
REREQ9P2R6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
REREQ9P2R6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
REREQ9P2R6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
REREQ9P2R6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
REREQ9P2R6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
REREQ9P2R6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC34.88■■■■□ 3.17
REREQ9P2R6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
REREQ9P2R6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
REREQ9P2R6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
REREQ9P2R6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
REREQ9P2R6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
REREQ9P2R6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
REREQ9P2R6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms