Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0T7

TMEM9, Transmembrane protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM9Q9P0T7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM9Q9P0T7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM9Q9P0T7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM9Q9P0T7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM9Q9P0T7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM9Q9P0T7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM9Q9P0T7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM9Q9P0T7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM9Q9P0T7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM9Q9P0T7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM9Q9P0T7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM9Q9P0T7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM9Q9P0T7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM9Q9P0T7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM9Q9P0T7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM9Q9P0T7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM9Q9P0T7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM9Q9P0T7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM9Q9P0T7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM9Q9P0T7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM9Q9P0T7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM9Q9P0T7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM9Q9P0T7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM9Q9P0T7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM9Q9P0T7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM9Q9P0T7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM9Q9P0T7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM9Q9P0T7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM9Q9P0T7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM9Q9P0T7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM9Q9P0T7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM9Q9P0T7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM9Q9P0T7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM9Q9P0T7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM9Q9P0T7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM9Q9P0T7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM9Q9P0T7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM9Q9P0T7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM9Q9P0T7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM9Q9P0T7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM9Q9P0T7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM9Q9P0T7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM9Q9P0T7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM9Q9P0T7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM9Q9P0T7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM9Q9P0T7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM9Q9P0T7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM9Q9P0T7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM9Q9P0T7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM9Q9P0T7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM9Q9P0T7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM9Q9P0T7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM9Q9P0T7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM9Q9P0T7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM9Q9P0T7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM9Q9P0T7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM9Q9P0T7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM9Q9P0T7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM9Q9P0T7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM9Q9P0T7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM9Q9P0T7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM9Q9P0T7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM9Q9P0T7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM9Q9P0T7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM9Q9P0T7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM9Q9P0T7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM9Q9P0T7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM9Q9P0T7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM9Q9P0T7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM9Q9P0T7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM9Q9P0T7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM9Q9P0T7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM9Q9P0T7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM9Q9P0T7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM9Q9P0T7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM9Q9P0T7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM9Q9P0T7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM9Q9P0T7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM9Q9P0T7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM9Q9P0T7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM9Q9P0T7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM9Q9P0T7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM9Q9P0T7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM9Q9P0T7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM9Q9P0T7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM9Q9P0T7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM9Q9P0T7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM9Q9P0T7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM9Q9P0T7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM9Q9P0T7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM9Q9P0T7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM9Q9P0T7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM9Q9P0T7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM9Q9P0T7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM9Q9P0T7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM9Q9P0T7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM9Q9P0T7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM9Q9P0T7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM9Q9P0T7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM9Q9P0T7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms