Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZG7

NINJ2, Ninjurin-2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINJ2Q9NZG7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NINJ2Q9NZG7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NINJ2Q9NZG7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NINJ2Q9NZG7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NINJ2Q9NZG7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NINJ2Q9NZG7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NINJ2Q9NZG7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NINJ2Q9NZG7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NINJ2Q9NZG7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NINJ2Q9NZG7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NINJ2Q9NZG7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NINJ2Q9NZG7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NINJ2Q9NZG7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NINJ2Q9NZG7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NINJ2Q9NZG7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NINJ2Q9NZG7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NINJ2Q9NZG7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NINJ2Q9NZG7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NINJ2Q9NZG7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NINJ2Q9NZG7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NINJ2Q9NZG7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NINJ2Q9NZG7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NINJ2Q9NZG7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NINJ2Q9NZG7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NINJ2Q9NZG7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NINJ2Q9NZG7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NINJ2Q9NZG7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NINJ2Q9NZG7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NINJ2Q9NZG7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NINJ2Q9NZG7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NINJ2Q9NZG7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NINJ2Q9NZG7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NINJ2Q9NZG7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NINJ2Q9NZG7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NINJ2Q9NZG7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NINJ2Q9NZG7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NINJ2Q9NZG7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NINJ2Q9NZG7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NINJ2Q9NZG7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NINJ2Q9NZG7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NINJ2Q9NZG7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NINJ2Q9NZG7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NINJ2Q9NZG7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NINJ2Q9NZG7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NINJ2Q9NZG7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NINJ2Q9NZG7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NINJ2Q9NZG7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NINJ2Q9NZG7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NINJ2Q9NZG7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NINJ2Q9NZG7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NINJ2Q9NZG7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NINJ2Q9NZG7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NINJ2Q9NZG7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NINJ2Q9NZG7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NINJ2Q9NZG7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NINJ2Q9NZG7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NINJ2Q9NZG7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NINJ2Q9NZG7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NINJ2Q9NZG7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NINJ2Q9NZG7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NINJ2Q9NZG7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NINJ2Q9NZG7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NINJ2Q9NZG7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NINJ2Q9NZG7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NINJ2Q9NZG7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NINJ2Q9NZG7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NINJ2Q9NZG7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NINJ2Q9NZG7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NINJ2Q9NZG7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NINJ2Q9NZG7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NINJ2Q9NZG7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NINJ2Q9NZG7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NINJ2Q9NZG7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NINJ2Q9NZG7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NINJ2Q9NZG7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NINJ2Q9NZG7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NINJ2Q9NZG7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NINJ2Q9NZG7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NINJ2Q9NZG7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NINJ2Q9NZG7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NINJ2Q9NZG7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NINJ2Q9NZG7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NINJ2Q9NZG7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NINJ2Q9NZG7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NINJ2Q9NZG7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NINJ2Q9NZG7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NINJ2Q9NZG7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NINJ2Q9NZG7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NINJ2Q9NZG7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NINJ2Q9NZG7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NINJ2Q9NZG7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NINJ2Q9NZG7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NINJ2Q9NZG7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NINJ2Q9NZG7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NINJ2Q9NZG7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NINJ2Q9NZG7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NINJ2Q9NZG7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NINJ2Q9NZG7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NINJ2Q9NZG7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NINJ2Q9NZG7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms