Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GDE1Q9NZC3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GDE1Q9NZC3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GDE1Q9NZC3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GDE1Q9NZC3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDE1Q9NZC3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDE1Q9NZC3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDE1Q9NZC3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDE1Q9NZC3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDE1Q9NZC3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDE1Q9NZC3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDE1Q9NZC3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDE1Q9NZC3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDE1Q9NZC3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GDE1Q9NZC3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GDE1Q9NZC3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GDE1Q9NZC3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GDE1Q9NZC3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GDE1Q9NZC3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GDE1Q9NZC3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GDE1Q9NZC3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDE1Q9NZC3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDE1Q9NZC3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GDE1Q9NZC3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDE1Q9NZC3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GDE1Q9NZC3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GDE1Q9NZC3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GDE1Q9NZC3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GDE1Q9NZC3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GDE1Q9NZC3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GDE1Q9NZC3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GDE1Q9NZC3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GDE1Q9NZC3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GDE1Q9NZC3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GDE1Q9NZC3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GDE1Q9NZC3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GDE1Q9NZC3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GDE1Q9NZC3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GDE1Q9NZC3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GDE1Q9NZC3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GDE1Q9NZC3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GDE1Q9NZC3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GDE1Q9NZC3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GDE1Q9NZC3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GDE1Q9NZC3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
GDE1Q9NZC3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GDE1Q9NZC3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GDE1Q9NZC3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GDE1Q9NZC3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GDE1Q9NZC3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GDE1Q9NZC3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GDE1Q9NZC3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GDE1Q9NZC3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GDE1Q9NZC3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GDE1Q9NZC3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDE1Q9NZC3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDE1Q9NZC3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDE1Q9NZC3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDE1Q9NZC3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDE1Q9NZC3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDE1Q9NZC3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDE1Q9NZC3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDE1Q9NZC3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDE1Q9NZC3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GDE1Q9NZC3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDE1Q9NZC3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDE1Q9NZC3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDE1Q9NZC3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDE1Q9NZC3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDE1Q9NZC3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDE1Q9NZC3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDE1Q9NZC3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDE1Q9NZC3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDE1Q9NZC3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDE1Q9NZC3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDE1Q9NZC3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDE1Q9NZC3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDE1Q9NZC3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDE1Q9NZC3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDE1Q9NZC3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GDE1Q9NZC3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDE1Q9NZC3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GDE1Q9NZC3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GDE1Q9NZC3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GDE1Q9NZC3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GDE1Q9NZC3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDE1Q9NZC3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDE1Q9NZC3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDE1Q9NZC3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDE1Q9NZC3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDE1Q9NZC3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDE1Q9NZC3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDE1Q9NZC3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDE1Q9NZC3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDE1Q9NZC3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GDE1Q9NZC3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GDE1Q9NZC3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GDE1Q9NZC3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GDE1Q9NZC3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GDE1Q9NZC3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
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