Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXX6

NSMCE4A, Non-structural maintenance of chromosomes element 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE4AQ9NXX6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NSMCE4AQ9NXX6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NSMCE4AQ9NXX6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NSMCE4AQ9NXX6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NSMCE4AQ9NXX6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSMCE4AQ9NXX6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSMCE4AQ9NXX6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSMCE4AQ9NXX6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSMCE4AQ9NXX6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NSMCE4AQ9NXX6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSMCE4AQ9NXX6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSMCE4AQ9NXX6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NSMCE4AQ9NXX6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSMCE4AQ9NXX6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSMCE4AQ9NXX6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSMCE4AQ9NXX6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSMCE4AQ9NXX6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSMCE4AQ9NXX6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSMCE4AQ9NXX6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSMCE4AQ9NXX6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSMCE4AQ9NXX6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSMCE4AQ9NXX6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSMCE4AQ9NXX6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSMCE4AQ9NXX6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSMCE4AQ9NXX6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NSMCE4AQ9NXX6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSMCE4AQ9NXX6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSMCE4AQ9NXX6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSMCE4AQ9NXX6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSMCE4AQ9NXX6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSMCE4AQ9NXX6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSMCE4AQ9NXX6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSMCE4AQ9NXX6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSMCE4AQ9NXX6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSMCE4AQ9NXX6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSMCE4AQ9NXX6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSMCE4AQ9NXX6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSMCE4AQ9NXX6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSMCE4AQ9NXX6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSMCE4AQ9NXX6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSMCE4AQ9NXX6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSMCE4AQ9NXX6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSMCE4AQ9NXX6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSMCE4AQ9NXX6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSMCE4AQ9NXX6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSMCE4AQ9NXX6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSMCE4AQ9NXX6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSMCE4AQ9NXX6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSMCE4AQ9NXX6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSMCE4AQ9NXX6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSMCE4AQ9NXX6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSMCE4AQ9NXX6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NSMCE4AQ9NXX6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSMCE4AQ9NXX6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSMCE4AQ9NXX6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSMCE4AQ9NXX6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSMCE4AQ9NXX6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSMCE4AQ9NXX6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSMCE4AQ9NXX6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSMCE4AQ9NXX6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSMCE4AQ9NXX6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSMCE4AQ9NXX6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSMCE4AQ9NXX6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSMCE4AQ9NXX6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSMCE4AQ9NXX6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSMCE4AQ9NXX6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSMCE4AQ9NXX6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSMCE4AQ9NXX6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSMCE4AQ9NXX6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSMCE4AQ9NXX6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSMCE4AQ9NXX6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSMCE4AQ9NXX6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSMCE4AQ9NXX6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSMCE4AQ9NXX6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSMCE4AQ9NXX6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSMCE4AQ9NXX6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSMCE4AQ9NXX6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSMCE4AQ9NXX6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSMCE4AQ9NXX6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSMCE4AQ9NXX6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSMCE4AQ9NXX6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NSMCE4AQ9NXX6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSMCE4AQ9NXX6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSMCE4AQ9NXX6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSMCE4AQ9NXX6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSMCE4AQ9NXX6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSMCE4AQ9NXX6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSMCE4AQ9NXX6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NSMCE4AQ9NXX6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NSMCE4AQ9NXX6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSMCE4AQ9NXX6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSMCE4AQ9NXX6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSMCE4AQ9NXX6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSMCE4AQ9NXX6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSMCE4AQ9NXX6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSMCE4AQ9NXX6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NSMCE4AQ9NXX6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSMCE4AQ9NXX6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSMCE4AQ9NXX6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSMCE4AQ9NXX6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms