Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KCNIP2Q9NS61 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms