Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB9BQ9NP90 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB9BQ9NP90 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB9BQ9NP90 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB9BQ9NP90 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB9BQ9NP90 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAB9BQ9NP90 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAB9BQ9NP90 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAB9BQ9NP90 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAB9BQ9NP90 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB9BQ9NP90 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RAB9BQ9NP90 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RAB9BQ9NP90 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB9BQ9NP90 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB9BQ9NP90 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB9BQ9NP90 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB9BQ9NP90 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB9BQ9NP90 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB9BQ9NP90 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB9BQ9NP90 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB9BQ9NP90 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB9BQ9NP90 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB9BQ9NP90 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB9BQ9NP90 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB9BQ9NP90 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB9BQ9NP90 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB9BQ9NP90 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB9BQ9NP90 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB9BQ9NP90 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB9BQ9NP90 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB9BQ9NP90 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB9BQ9NP90 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB9BQ9NP90 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB9BQ9NP90 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB9BQ9NP90 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms