Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU0

CD248, Endosialin, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD248Q9HCU0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CD248Q9HCU0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CD248Q9HCU0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CD248Q9HCU0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD248Q9HCU0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD248Q9HCU0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD248Q9HCU0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD248Q9HCU0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD248Q9HCU0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD248Q9HCU0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CD248Q9HCU0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD248Q9HCU0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CD248Q9HCU0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD248Q9HCU0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD248Q9HCU0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD248Q9HCU0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD248Q9HCU0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD248Q9HCU0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD248Q9HCU0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD248Q9HCU0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD248Q9HCU0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CD248Q9HCU0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD248Q9HCU0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD248Q9HCU0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD248Q9HCU0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD248Q9HCU0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD248Q9HCU0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD248Q9HCU0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD248Q9HCU0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD248Q9HCU0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD248Q9HCU0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD248Q9HCU0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD248Q9HCU0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD248Q9HCU0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD248Q9HCU0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD248Q9HCU0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD248Q9HCU0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD248Q9HCU0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD248Q9HCU0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD248Q9HCU0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD248Q9HCU0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD248Q9HCU0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD248Q9HCU0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD248Q9HCU0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD248Q9HCU0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CD248Q9HCU0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD248Q9HCU0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD248Q9HCU0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD248Q9HCU0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD248Q9HCU0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD248Q9HCU0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CD248Q9HCU0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD248Q9HCU0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD248Q9HCU0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD248Q9HCU0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD248Q9HCU0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CD248Q9HCU0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD248Q9HCU0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD248Q9HCU0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD248Q9HCU0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD248Q9HCU0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD248Q9HCU0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD248Q9HCU0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD248Q9HCU0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD248Q9HCU0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD248Q9HCU0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD248Q9HCU0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD248Q9HCU0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD248Q9HCU0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD248Q9HCU0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD248Q9HCU0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD248Q9HCU0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD248Q9HCU0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD248Q9HCU0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD248Q9HCU0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD248Q9HCU0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CD248Q9HCU0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD248Q9HCU0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD248Q9HCU0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD248Q9HCU0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD248Q9HCU0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD248Q9HCU0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD248Q9HCU0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD248Q9HCU0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD248Q9HCU0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CD248Q9HCU0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD248Q9HCU0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD248Q9HCU0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD248Q9HCU0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD248Q9HCU0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD248Q9HCU0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD248Q9HCU0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD248Q9HCU0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD248Q9HCU0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD248Q9HCU0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD248Q9HCU0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CD248Q9HCU0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD248Q9HCU0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD248Q9HCU0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD248Q9HCU0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms