Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBV1

POPDC3, Popeye domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POPDC3Q9HBV1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POPDC3Q9HBV1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POPDC3Q9HBV1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POPDC3Q9HBV1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POPDC3Q9HBV1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POPDC3Q9HBV1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23■■□□□ 1.27
POPDC3Q9HBV1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POPDC3Q9HBV1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POPDC3Q9HBV1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POPDC3Q9HBV1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POPDC3Q9HBV1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POPDC3Q9HBV1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POPDC3Q9HBV1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POPDC3Q9HBV1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POPDC3Q9HBV1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POPDC3Q9HBV1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POPDC3Q9HBV1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POPDC3Q9HBV1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
POPDC3Q9HBV1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POPDC3Q9HBV1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POPDC3Q9HBV1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
POPDC3Q9HBV1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
POPDC3Q9HBV1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POPDC3Q9HBV1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POPDC3Q9HBV1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POPDC3Q9HBV1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POPDC3Q9HBV1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POPDC3Q9HBV1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POPDC3Q9HBV1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POPDC3Q9HBV1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POPDC3Q9HBV1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POPDC3Q9HBV1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POPDC3Q9HBV1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POPDC3Q9HBV1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POPDC3Q9HBV1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POPDC3Q9HBV1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POPDC3Q9HBV1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POPDC3Q9HBV1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POPDC3Q9HBV1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POPDC3Q9HBV1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POPDC3Q9HBV1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POPDC3Q9HBV1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POPDC3Q9HBV1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POPDC3Q9HBV1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POPDC3Q9HBV1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POPDC3Q9HBV1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POPDC3Q9HBV1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
POPDC3Q9HBV1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POPDC3Q9HBV1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POPDC3Q9HBV1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POPDC3Q9HBV1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
POPDC3Q9HBV1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POPDC3Q9HBV1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POPDC3Q9HBV1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POPDC3Q9HBV1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POPDC3Q9HBV1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POPDC3Q9HBV1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POPDC3Q9HBV1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POPDC3Q9HBV1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POPDC3Q9HBV1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POPDC3Q9HBV1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POPDC3Q9HBV1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POPDC3Q9HBV1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POPDC3Q9HBV1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POPDC3Q9HBV1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POPDC3Q9HBV1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POPDC3Q9HBV1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POPDC3Q9HBV1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
POPDC3Q9HBV1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POPDC3Q9HBV1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POPDC3Q9HBV1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POPDC3Q9HBV1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POPDC3Q9HBV1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POPDC3Q9HBV1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POPDC3Q9HBV1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POPDC3Q9HBV1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POPDC3Q9HBV1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POPDC3Q9HBV1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POPDC3Q9HBV1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POPDC3Q9HBV1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POPDC3Q9HBV1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POPDC3Q9HBV1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POPDC3Q9HBV1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POPDC3Q9HBV1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POPDC3Q9HBV1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POPDC3Q9HBV1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POPDC3Q9HBV1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POPDC3Q9HBV1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POPDC3Q9HBV1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POPDC3Q9HBV1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POPDC3Q9HBV1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POPDC3Q9HBV1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POPDC3Q9HBV1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
POPDC3Q9HBV1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
POPDC3Q9HBV1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POPDC3Q9HBV1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POPDC3Q9HBV1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POPDC3Q9HBV1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POPDC3Q9HBV1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POPDC3Q9HBV1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms