Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP29Q9HBJ7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP29Q9HBJ7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP29Q9HBJ7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP29Q9HBJ7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP29Q9HBJ7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP29Q9HBJ7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP29Q9HBJ7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
USP29Q9HBJ7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP29Q9HBJ7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP29Q9HBJ7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP29Q9HBJ7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP29Q9HBJ7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP29Q9HBJ7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP29Q9HBJ7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
USP29Q9HBJ7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP29Q9HBJ7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP29Q9HBJ7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP29Q9HBJ7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP29Q9HBJ7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP29Q9HBJ7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP29Q9HBJ7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP29Q9HBJ7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP29Q9HBJ7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP29Q9HBJ7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
USP29Q9HBJ7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP29Q9HBJ7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP29Q9HBJ7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP29Q9HBJ7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP29Q9HBJ7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
USP29Q9HBJ7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP29Q9HBJ7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP29Q9HBJ7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP29Q9HBJ7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP29Q9HBJ7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
USP29Q9HBJ7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP29Q9HBJ7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP29Q9HBJ7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP29Q9HBJ7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
USP29Q9HBJ7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
USP29Q9HBJ7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP29Q9HBJ7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP29Q9HBJ7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP29Q9HBJ7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP29Q9HBJ7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP29Q9HBJ7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP29Q9HBJ7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP29Q9HBJ7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP29Q9HBJ7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP29Q9HBJ7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP29Q9HBJ7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
USP29Q9HBJ7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP29Q9HBJ7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP29Q9HBJ7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP29Q9HBJ7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP29Q9HBJ7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP29Q9HBJ7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP29Q9HBJ7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP29Q9HBJ7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP29Q9HBJ7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP29Q9HBJ7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP29Q9HBJ7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP29Q9HBJ7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP29Q9HBJ7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP29Q9HBJ7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP29Q9HBJ7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
USP29Q9HBJ7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP29Q9HBJ7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP29Q9HBJ7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP29Q9HBJ7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP29Q9HBJ7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP29Q9HBJ7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP29Q9HBJ7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP29Q9HBJ7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP29Q9HBJ7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP29Q9HBJ7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP29Q9HBJ7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP29Q9HBJ7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
USP29Q9HBJ7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP29Q9HBJ7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP29Q9HBJ7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP29Q9HBJ7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP29Q9HBJ7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP29Q9HBJ7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP29Q9HBJ7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP29Q9HBJ7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP29Q9HBJ7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP29Q9HBJ7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP29Q9HBJ7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
USP29Q9HBJ7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP29Q9HBJ7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP29Q9HBJ7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP29Q9HBJ7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP29Q9HBJ7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP29Q9HBJ7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP29Q9HBJ7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP29Q9HBJ7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
USP29Q9HBJ7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP29Q9HBJ7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP29Q9HBJ7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms