Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2F9

CCDC68, Coiled-coil domain-containing protein 68, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC68Q9H2F9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC68Q9H2F9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC68Q9H2F9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC68Q9H2F9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC68Q9H2F9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC68Q9H2F9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC68Q9H2F9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC68Q9H2F9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC68Q9H2F9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC68Q9H2F9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC68Q9H2F9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC68Q9H2F9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC68Q9H2F9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC68Q9H2F9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC68Q9H2F9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC68Q9H2F9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC68Q9H2F9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC68Q9H2F9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC68Q9H2F9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC68Q9H2F9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC68Q9H2F9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC68Q9H2F9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC68Q9H2F9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC68Q9H2F9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC68Q9H2F9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC68Q9H2F9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC68Q9H2F9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC68Q9H2F9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC68Q9H2F9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC68Q9H2F9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC68Q9H2F9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC68Q9H2F9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC68Q9H2F9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC68Q9H2F9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC68Q9H2F9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC68Q9H2F9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC68Q9H2F9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC68Q9H2F9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC68Q9H2F9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC68Q9H2F9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC68Q9H2F9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC68Q9H2F9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC68Q9H2F9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC68Q9H2F9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC68Q9H2F9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC68Q9H2F9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC68Q9H2F9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC68Q9H2F9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC68Q9H2F9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC68Q9H2F9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC68Q9H2F9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC68Q9H2F9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC68Q9H2F9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC68Q9H2F9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC68Q9H2F9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC68Q9H2F9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC68Q9H2F9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC68Q9H2F9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC68Q9H2F9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC68Q9H2F9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC68Q9H2F9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC68Q9H2F9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC68Q9H2F9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC68Q9H2F9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC68Q9H2F9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC68Q9H2F9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC68Q9H2F9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC68Q9H2F9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC68Q9H2F9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC68Q9H2F9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC68Q9H2F9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC68Q9H2F9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC68Q9H2F9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC68Q9H2F9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC68Q9H2F9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC68Q9H2F9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC68Q9H2F9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC68Q9H2F9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC68Q9H2F9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC68Q9H2F9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC68Q9H2F9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC68Q9H2F9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC68Q9H2F9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC68Q9H2F9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC68Q9H2F9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC68Q9H2F9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC68Q9H2F9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC68Q9H2F9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC68Q9H2F9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC68Q9H2F9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC68Q9H2F9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC68Q9H2F9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC68Q9H2F9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC68Q9H2F9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC68Q9H2F9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC68Q9H2F9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC68Q9H2F9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC68Q9H2F9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC68Q9H2F9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC68Q9H2F9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms