Protein–RNA interactions for Protein: Q9H074

PAIP1, Polyadenylate-binding protein-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAIP1Q9H074 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PAIP1Q9H074 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAIP1Q9H074 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAIP1Q9H074 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PAIP1Q9H074 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PAIP1Q9H074 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAIP1Q9H074 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAIP1Q9H074 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAIP1Q9H074 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAIP1Q9H074 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PAIP1Q9H074 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAIP1Q9H074 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAIP1Q9H074 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PAIP1Q9H074 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PAIP1Q9H074 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAIP1Q9H074 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAIP1Q9H074 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAIP1Q9H074 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAIP1Q9H074 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAIP1Q9H074 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAIP1Q9H074 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAIP1Q9H074 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAIP1Q9H074 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAIP1Q9H074 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAIP1Q9H074 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAIP1Q9H074 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAIP1Q9H074 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAIP1Q9H074 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAIP1Q9H074 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAIP1Q9H074 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAIP1Q9H074 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAIP1Q9H074 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PAIP1Q9H074 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAIP1Q9H074 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAIP1Q9H074 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAIP1Q9H074 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAIP1Q9H074 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAIP1Q9H074 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAIP1Q9H074 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAIP1Q9H074 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAIP1Q9H074 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAIP1Q9H074 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAIP1Q9H074 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAIP1Q9H074 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAIP1Q9H074 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAIP1Q9H074 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAIP1Q9H074 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAIP1Q9H074 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAIP1Q9H074 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAIP1Q9H074 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAIP1Q9H074 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAIP1Q9H074 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAIP1Q9H074 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAIP1Q9H074 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAIP1Q9H074 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAIP1Q9H074 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAIP1Q9H074 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAIP1Q9H074 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAIP1Q9H074 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAIP1Q9H074 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAIP1Q9H074 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAIP1Q9H074 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAIP1Q9H074 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAIP1Q9H074 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAIP1Q9H074 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAIP1Q9H074 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAIP1Q9H074 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAIP1Q9H074 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAIP1Q9H074 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAIP1Q9H074 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAIP1Q9H074 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAIP1Q9H074 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAIP1Q9H074 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAIP1Q9H074 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAIP1Q9H074 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PAIP1Q9H074 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAIP1Q9H074 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAIP1Q9H074 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAIP1Q9H074 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PAIP1Q9H074 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PAIP1Q9H074 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PAIP1Q9H074 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PAIP1Q9H074 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAIP1Q9H074 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAIP1Q9H074 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAIP1Q9H074 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAIP1Q9H074 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAIP1Q9H074 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAIP1Q9H074 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAIP1Q9H074 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAIP1Q9H074 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAIP1Q9H074 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PAIP1Q9H074 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAIP1Q9H074 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAIP1Q9H074 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAIP1Q9H074 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAIP1Q9H074 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAIP1Q9H074 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAIP1Q9H074 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAIP1Q9H074 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms