Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC90BQ9GZT6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC90BQ9GZT6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC90BQ9GZT6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC90BQ9GZT6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC90BQ9GZT6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC90BQ9GZT6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC90BQ9GZT6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC90BQ9GZT6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC90BQ9GZT6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC90BQ9GZT6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC90BQ9GZT6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC90BQ9GZT6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC90BQ9GZT6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC90BQ9GZT6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC90BQ9GZT6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC90BQ9GZT6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC90BQ9GZT6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC90BQ9GZT6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC90BQ9GZT6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC90BQ9GZT6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC90BQ9GZT6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC90BQ9GZT6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC90BQ9GZT6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC90BQ9GZT6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC90BQ9GZT6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC90BQ9GZT6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC90BQ9GZT6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC90BQ9GZT6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC90BQ9GZT6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC90BQ9GZT6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC90BQ9GZT6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC90BQ9GZT6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC90BQ9GZT6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC90BQ9GZT6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC90BQ9GZT6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC90BQ9GZT6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC90BQ9GZT6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC90BQ9GZT6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC90BQ9GZT6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC90BQ9GZT6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC90BQ9GZT6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC90BQ9GZT6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC90BQ9GZT6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC90BQ9GZT6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC90BQ9GZT6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC90BQ9GZT6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC90BQ9GZT6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC90BQ9GZT6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC90BQ9GZT6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC90BQ9GZT6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC90BQ9GZT6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC90BQ9GZT6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC90BQ9GZT6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC90BQ9GZT6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC90BQ9GZT6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC90BQ9GZT6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC90BQ9GZT6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC90BQ9GZT6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC90BQ9GZT6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC90BQ9GZT6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC90BQ9GZT6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC90BQ9GZT6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC90BQ9GZT6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC90BQ9GZT6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC90BQ9GZT6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC90BQ9GZT6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC90BQ9GZT6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC90BQ9GZT6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC90BQ9GZT6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC90BQ9GZT6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC90BQ9GZT6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC90BQ9GZT6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC90BQ9GZT6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC90BQ9GZT6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC90BQ9GZT6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC90BQ9GZT6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC90BQ9GZT6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC90BQ9GZT6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC90BQ9GZT6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC90BQ9GZT6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC90BQ9GZT6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC90BQ9GZT6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC90BQ9GZT6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC90BQ9GZT6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC90BQ9GZT6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC90BQ9GZT6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC90BQ9GZT6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC90BQ9GZT6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC90BQ9GZT6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC90BQ9GZT6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC90BQ9GZT6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC90BQ9GZT6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC90BQ9GZT6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC90BQ9GZT6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC90BQ9GZT6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC90BQ9GZT6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC90BQ9GZT6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC90BQ9GZT6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC90BQ9GZT6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms