Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR1

SENP6, Sentrin-specific protease 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6Q9GZR1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SENP6Q9GZR1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SENP6Q9GZR1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SENP6Q9GZR1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SENP6Q9GZR1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SENP6Q9GZR1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SENP6Q9GZR1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SENP6Q9GZR1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SENP6Q9GZR1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SENP6Q9GZR1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SENP6Q9GZR1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SENP6Q9GZR1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SENP6Q9GZR1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SENP6Q9GZR1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SENP6Q9GZR1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SENP6Q9GZR1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SENP6Q9GZR1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SENP6Q9GZR1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SENP6Q9GZR1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SENP6Q9GZR1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SENP6Q9GZR1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SENP6Q9GZR1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SENP6Q9GZR1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SENP6Q9GZR1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SENP6Q9GZR1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SENP6Q9GZR1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SENP6Q9GZR1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SENP6Q9GZR1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SENP6Q9GZR1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SENP6Q9GZR1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SENP6Q9GZR1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SENP6Q9GZR1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SENP6Q9GZR1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SENP6Q9GZR1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SENP6Q9GZR1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SENP6Q9GZR1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SENP6Q9GZR1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SENP6Q9GZR1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SENP6Q9GZR1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SENP6Q9GZR1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SENP6Q9GZR1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SENP6Q9GZR1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SENP6Q9GZR1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SENP6Q9GZR1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SENP6Q9GZR1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SENP6Q9GZR1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SENP6Q9GZR1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SENP6Q9GZR1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SENP6Q9GZR1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SENP6Q9GZR1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SENP6Q9GZR1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SENP6Q9GZR1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SENP6Q9GZR1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SENP6Q9GZR1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SENP6Q9GZR1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SENP6Q9GZR1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SENP6Q9GZR1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SENP6Q9GZR1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SENP6Q9GZR1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SENP6Q9GZR1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SENP6Q9GZR1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SENP6Q9GZR1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SENP6Q9GZR1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SENP6Q9GZR1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SENP6Q9GZR1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SENP6Q9GZR1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SENP6Q9GZR1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SENP6Q9GZR1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SENP6Q9GZR1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SENP6Q9GZR1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SENP6Q9GZR1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SENP6Q9GZR1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SENP6Q9GZR1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SENP6Q9GZR1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SENP6Q9GZR1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SENP6Q9GZR1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SENP6Q9GZR1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SENP6Q9GZR1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SENP6Q9GZR1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SENP6Q9GZR1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SENP6Q9GZR1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SENP6Q9GZR1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SENP6Q9GZR1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SENP6Q9GZR1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SENP6Q9GZR1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SENP6Q9GZR1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SENP6Q9GZR1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SENP6Q9GZR1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SENP6Q9GZR1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SENP6Q9GZR1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SENP6Q9GZR1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SENP6Q9GZR1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SENP6Q9GZR1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SENP6Q9GZR1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SENP6Q9GZR1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SENP6Q9GZR1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SENP6Q9GZR1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SENP6Q9GZR1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SENP6Q9GZR1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SENP6Q9GZR1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms