Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K3

ACTR3C, Actin-related protein 3C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3CQ9C0K3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTR3CQ9C0K3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTR3CQ9C0K3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTR3CQ9C0K3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTR3CQ9C0K3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTR3CQ9C0K3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTR3CQ9C0K3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTR3CQ9C0K3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTR3CQ9C0K3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTR3CQ9C0K3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTR3CQ9C0K3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTR3CQ9C0K3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTR3CQ9C0K3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTR3CQ9C0K3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTR3CQ9C0K3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTR3CQ9C0K3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTR3CQ9C0K3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTR3CQ9C0K3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTR3CQ9C0K3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTR3CQ9C0K3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTR3CQ9C0K3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTR3CQ9C0K3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTR3CQ9C0K3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTR3CQ9C0K3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTR3CQ9C0K3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTR3CQ9C0K3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTR3CQ9C0K3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTR3CQ9C0K3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTR3CQ9C0K3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTR3CQ9C0K3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTR3CQ9C0K3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTR3CQ9C0K3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTR3CQ9C0K3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTR3CQ9C0K3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTR3CQ9C0K3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTR3CQ9C0K3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTR3CQ9C0K3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTR3CQ9C0K3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTR3CQ9C0K3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTR3CQ9C0K3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTR3CQ9C0K3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTR3CQ9C0K3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTR3CQ9C0K3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTR3CQ9C0K3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ACTR3CQ9C0K3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 435.6 ms