Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BHLHE41Q9C0J9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BHLHE41Q9C0J9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BHLHE41Q9C0J9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BHLHE41Q9C0J9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BHLHE41Q9C0J9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BHLHE41Q9C0J9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BHLHE41Q9C0J9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BHLHE41Q9C0J9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BHLHE41Q9C0J9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BHLHE41Q9C0J9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BHLHE41Q9C0J9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BHLHE41Q9C0J9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BHLHE41Q9C0J9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BHLHE41Q9C0J9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BHLHE41Q9C0J9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BHLHE41Q9C0J9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHLHE41Q9C0J9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHLHE41Q9C0J9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHLHE41Q9C0J9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHLHE41Q9C0J9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BHLHE41Q9C0J9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHLHE41Q9C0J9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHLHE41Q9C0J9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BHLHE41Q9C0J9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHLHE41Q9C0J9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHLHE41Q9C0J9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHLHE41Q9C0J9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHLHE41Q9C0J9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHLHE41Q9C0J9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BHLHE41Q9C0J9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHLHE41Q9C0J9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHLHE41Q9C0J9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHLHE41Q9C0J9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHLHE41Q9C0J9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHLHE41Q9C0J9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BHLHE41Q9C0J9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BHLHE41Q9C0J9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BHLHE41Q9C0J9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BHLHE41Q9C0J9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BHLHE41Q9C0J9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BHLHE41Q9C0J9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BHLHE41Q9C0J9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BHLHE41Q9C0J9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BHLHE41Q9C0J9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BHLHE41Q9C0J9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BHLHE41Q9C0J9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BHLHE41Q9C0J9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BHLHE41Q9C0J9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BHLHE41Q9C0J9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BHLHE41Q9C0J9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BHLHE41Q9C0J9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BHLHE41Q9C0J9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BHLHE41Q9C0J9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BHLHE41Q9C0J9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BHLHE41Q9C0J9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BHLHE41Q9C0J9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BHLHE41Q9C0J9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BHLHE41Q9C0J9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BHLHE41Q9C0J9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BHLHE41Q9C0J9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BHLHE41Q9C0J9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BHLHE41Q9C0J9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BHLHE41Q9C0J9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BHLHE41Q9C0J9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BHLHE41Q9C0J9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BHLHE41Q9C0J9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BHLHE41Q9C0J9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BHLHE41Q9C0J9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BHLHE41Q9C0J9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BHLHE41Q9C0J9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BHLHE41Q9C0J9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BHLHE41Q9C0J9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHLHE41Q9C0J9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHLHE41Q9C0J9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHLHE41Q9C0J9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHLHE41Q9C0J9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHLHE41Q9C0J9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHLHE41Q9C0J9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHLHE41Q9C0J9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHLHE41Q9C0J9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHLHE41Q9C0J9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHLHE41Q9C0J9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHLHE41Q9C0J9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHLHE41Q9C0J9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHLHE41Q9C0J9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHLHE41Q9C0J9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BHLHE41Q9C0J9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHLHE41Q9C0J9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHLHE41Q9C0J9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHLHE41Q9C0J9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHLHE41Q9C0J9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHLHE41Q9C0J9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHLHE41Q9C0J9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHLHE41Q9C0J9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHLHE41Q9C0J9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHLHE41Q9C0J9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHLHE41Q9C0J9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHLHE41Q9C0J9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHLHE41Q9C0J9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms