Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TM6SF1Q9BZW5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TM6SF1Q9BZW5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TM6SF1Q9BZW5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TM6SF1Q9BZW5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TM6SF1Q9BZW5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TM6SF1Q9BZW5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TM6SF1Q9BZW5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TM6SF1Q9BZW5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TM6SF1Q9BZW5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TM6SF1Q9BZW5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TM6SF1Q9BZW5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TM6SF1Q9BZW5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TM6SF1Q9BZW5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TM6SF1Q9BZW5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TM6SF1Q9BZW5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TM6SF1Q9BZW5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TM6SF1Q9BZW5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TM6SF1Q9BZW5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TM6SF1Q9BZW5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TM6SF1Q9BZW5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TM6SF1Q9BZW5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TM6SF1Q9BZW5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TM6SF1Q9BZW5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TM6SF1Q9BZW5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TM6SF1Q9BZW5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TM6SF1Q9BZW5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TM6SF1Q9BZW5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TM6SF1Q9BZW5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TM6SF1Q9BZW5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TM6SF1Q9BZW5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TM6SF1Q9BZW5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TM6SF1Q9BZW5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TM6SF1Q9BZW5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TM6SF1Q9BZW5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TM6SF1Q9BZW5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TM6SF1Q9BZW5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TM6SF1Q9BZW5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TM6SF1Q9BZW5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TM6SF1Q9BZW5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TM6SF1Q9BZW5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TM6SF1Q9BZW5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TM6SF1Q9BZW5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TM6SF1Q9BZW5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TM6SF1Q9BZW5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TM6SF1Q9BZW5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TM6SF1Q9BZW5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TM6SF1Q9BZW5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TM6SF1Q9BZW5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TM6SF1Q9BZW5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TM6SF1Q9BZW5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TM6SF1Q9BZW5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TM6SF1Q9BZW5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TM6SF1Q9BZW5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TM6SF1Q9BZW5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TM6SF1Q9BZW5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TM6SF1Q9BZW5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TM6SF1Q9BZW5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TM6SF1Q9BZW5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TM6SF1Q9BZW5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TM6SF1Q9BZW5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TM6SF1Q9BZW5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TM6SF1Q9BZW5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TM6SF1Q9BZW5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TM6SF1Q9BZW5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TM6SF1Q9BZW5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
TM6SF1Q9BZW5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TM6SF1Q9BZW5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TM6SF1Q9BZW5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TM6SF1Q9BZW5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TM6SF1Q9BZW5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TM6SF1Q9BZW5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
TM6SF1Q9BZW5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TM6SF1Q9BZW5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TM6SF1Q9BZW5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TM6SF1Q9BZW5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TM6SF1Q9BZW5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TM6SF1Q9BZW5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TM6SF1Q9BZW5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TM6SF1Q9BZW5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TM6SF1Q9BZW5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TM6SF1Q9BZW5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TM6SF1Q9BZW5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TM6SF1Q9BZW5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TM6SF1Q9BZW5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TM6SF1Q9BZW5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TM6SF1Q9BZW5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TM6SF1Q9BZW5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TM6SF1Q9BZW5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TM6SF1Q9BZW5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TM6SF1Q9BZW5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TM6SF1Q9BZW5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TM6SF1Q9BZW5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TM6SF1Q9BZW5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TM6SF1Q9BZW5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TM6SF1Q9BZW5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TM6SF1Q9BZW5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TM6SF1Q9BZW5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TM6SF1Q9BZW5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TM6SF1Q9BZW5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms