Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVM2

DPCD, Protein DPCD, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPCDQ9BVM2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DPCDQ9BVM2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DPCDQ9BVM2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DPCDQ9BVM2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DPCDQ9BVM2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DPCDQ9BVM2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DPCDQ9BVM2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
DPCDQ9BVM2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DPCDQ9BVM2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DPCDQ9BVM2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DPCDQ9BVM2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DPCDQ9BVM2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DPCDQ9BVM2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DPCDQ9BVM2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DPCDQ9BVM2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DPCDQ9BVM2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DPCDQ9BVM2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DPCDQ9BVM2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DPCDQ9BVM2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DPCDQ9BVM2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DPCDQ9BVM2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DPCDQ9BVM2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DPCDQ9BVM2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DPCDQ9BVM2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DPCDQ9BVM2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DPCDQ9BVM2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DPCDQ9BVM2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DPCDQ9BVM2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DPCDQ9BVM2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DPCDQ9BVM2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DPCDQ9BVM2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DPCDQ9BVM2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DPCDQ9BVM2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DPCDQ9BVM2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DPCDQ9BVM2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DPCDQ9BVM2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DPCDQ9BVM2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DPCDQ9BVM2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DPCDQ9BVM2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DPCDQ9BVM2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DPCDQ9BVM2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DPCDQ9BVM2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DPCDQ9BVM2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DPCDQ9BVM2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DPCDQ9BVM2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DPCDQ9BVM2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DPCDQ9BVM2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DPCDQ9BVM2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DPCDQ9BVM2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DPCDQ9BVM2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DPCDQ9BVM2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DPCDQ9BVM2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DPCDQ9BVM2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DPCDQ9BVM2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DPCDQ9BVM2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DPCDQ9BVM2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DPCDQ9BVM2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DPCDQ9BVM2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DPCDQ9BVM2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DPCDQ9BVM2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DPCDQ9BVM2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DPCDQ9BVM2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DPCDQ9BVM2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DPCDQ9BVM2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DPCDQ9BVM2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DPCDQ9BVM2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DPCDQ9BVM2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DPCDQ9BVM2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DPCDQ9BVM2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DPCDQ9BVM2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DPCDQ9BVM2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DPCDQ9BVM2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DPCDQ9BVM2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DPCDQ9BVM2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DPCDQ9BVM2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DPCDQ9BVM2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DPCDQ9BVM2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DPCDQ9BVM2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DPCDQ9BVM2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DPCDQ9BVM2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DPCDQ9BVM2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DPCDQ9BVM2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DPCDQ9BVM2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DPCDQ9BVM2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DPCDQ9BVM2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DPCDQ9BVM2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DPCDQ9BVM2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DPCDQ9BVM2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DPCDQ9BVM2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DPCDQ9BVM2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DPCDQ9BVM2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DPCDQ9BVM2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DPCDQ9BVM2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DPCDQ9BVM2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DPCDQ9BVM2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DPCDQ9BVM2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DPCDQ9BVM2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DPCDQ9BVM2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DPCDQ9BVM2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DPCDQ9BVM2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms