Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSR8

YIPF4, Protein YIPF4, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF4Q9BSR8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
YIPF4Q9BSR8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
YIPF4Q9BSR8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
YIPF4Q9BSR8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
YIPF4Q9BSR8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
YIPF4Q9BSR8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
YIPF4Q9BSR8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
YIPF4Q9BSR8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
YIPF4Q9BSR8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
YIPF4Q9BSR8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
YIPF4Q9BSR8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
YIPF4Q9BSR8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
YIPF4Q9BSR8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
YIPF4Q9BSR8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
YIPF4Q9BSR8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
YIPF4Q9BSR8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
YIPF4Q9BSR8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
YIPF4Q9BSR8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
YIPF4Q9BSR8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
YIPF4Q9BSR8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
YIPF4Q9BSR8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
YIPF4Q9BSR8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
YIPF4Q9BSR8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
YIPF4Q9BSR8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
YIPF4Q9BSR8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
YIPF4Q9BSR8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
YIPF4Q9BSR8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
YIPF4Q9BSR8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
YIPF4Q9BSR8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
YIPF4Q9BSR8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
YIPF4Q9BSR8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
YIPF4Q9BSR8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
YIPF4Q9BSR8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
YIPF4Q9BSR8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
YIPF4Q9BSR8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms