Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TINF2Q9BSI4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TINF2Q9BSI4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TINF2Q9BSI4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TINF2Q9BSI4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TINF2Q9BSI4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TINF2Q9BSI4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TINF2Q9BSI4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TINF2Q9BSI4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TINF2Q9BSI4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TINF2Q9BSI4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TINF2Q9BSI4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TINF2Q9BSI4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TINF2Q9BSI4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TINF2Q9BSI4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TINF2Q9BSI4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TINF2Q9BSI4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TINF2Q9BSI4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TINF2Q9BSI4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TINF2Q9BSI4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TINF2Q9BSI4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TINF2Q9BSI4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TINF2Q9BSI4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TINF2Q9BSI4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TINF2Q9BSI4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TINF2Q9BSI4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TINF2Q9BSI4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TINF2Q9BSI4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TINF2Q9BSI4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TINF2Q9BSI4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TINF2Q9BSI4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TINF2Q9BSI4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TINF2Q9BSI4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TINF2Q9BSI4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TINF2Q9BSI4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TINF2Q9BSI4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TINF2Q9BSI4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TINF2Q9BSI4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TINF2Q9BSI4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TINF2Q9BSI4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TINF2Q9BSI4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TINF2Q9BSI4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TINF2Q9BSI4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TINF2Q9BSI4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TINF2Q9BSI4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TINF2Q9BSI4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TINF2Q9BSI4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TINF2Q9BSI4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TINF2Q9BSI4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TINF2Q9BSI4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TINF2Q9BSI4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TINF2Q9BSI4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TINF2Q9BSI4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TINF2Q9BSI4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TINF2Q9BSI4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TINF2Q9BSI4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TINF2Q9BSI4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TINF2Q9BSI4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TINF2Q9BSI4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TINF2Q9BSI4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TINF2Q9BSI4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TINF2Q9BSI4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TINF2Q9BSI4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TINF2Q9BSI4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TINF2Q9BSI4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TINF2Q9BSI4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TINF2Q9BSI4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TINF2Q9BSI4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TINF2Q9BSI4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TINF2Q9BSI4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TINF2Q9BSI4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TINF2Q9BSI4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TINF2Q9BSI4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TINF2Q9BSI4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TINF2Q9BSI4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TINF2Q9BSI4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TINF2Q9BSI4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TINF2Q9BSI4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TINF2Q9BSI4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TINF2Q9BSI4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TINF2Q9BSI4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TINF2Q9BSI4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TINF2Q9BSI4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TINF2Q9BSI4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TINF2Q9BSI4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TINF2Q9BSI4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TINF2Q9BSI4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TINF2Q9BSI4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TINF2Q9BSI4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TINF2Q9BSI4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TINF2Q9BSI4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TINF2Q9BSI4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TINF2Q9BSI4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TINF2Q9BSI4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TINF2Q9BSI4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TINF2Q9BSI4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TINF2Q9BSI4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TINF2Q9BSI4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TINF2Q9BSI4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TINF2Q9BSI4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms