Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSB4

ATG101, Autophagy-related protein 101, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG101Q9BSB4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG101Q9BSB4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG101Q9BSB4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG101Q9BSB4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG101Q9BSB4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG101Q9BSB4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG101Q9BSB4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG101Q9BSB4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG101Q9BSB4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG101Q9BSB4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG101Q9BSB4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG101Q9BSB4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG101Q9BSB4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG101Q9BSB4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG101Q9BSB4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG101Q9BSB4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG101Q9BSB4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG101Q9BSB4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG101Q9BSB4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG101Q9BSB4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG101Q9BSB4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG101Q9BSB4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG101Q9BSB4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG101Q9BSB4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG101Q9BSB4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG101Q9BSB4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG101Q9BSB4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG101Q9BSB4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG101Q9BSB4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG101Q9BSB4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG101Q9BSB4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG101Q9BSB4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG101Q9BSB4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG101Q9BSB4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG101Q9BSB4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG101Q9BSB4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG101Q9BSB4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG101Q9BSB4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG101Q9BSB4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG101Q9BSB4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG101Q9BSB4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG101Q9BSB4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG101Q9BSB4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG101Q9BSB4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG101Q9BSB4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG101Q9BSB4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG101Q9BSB4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG101Q9BSB4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG101Q9BSB4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG101Q9BSB4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG101Q9BSB4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms