Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ70

TCF25, Transcription factor 25, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF25Q9BQ70 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCF25Q9BQ70 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TCF25Q9BQ70 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TCF25Q9BQ70 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TCF25Q9BQ70 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TCF25Q9BQ70 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TCF25Q9BQ70 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCF25Q9BQ70 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCF25Q9BQ70 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCF25Q9BQ70 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCF25Q9BQ70 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCF25Q9BQ70 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCF25Q9BQ70 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCF25Q9BQ70 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCF25Q9BQ70 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCF25Q9BQ70 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCF25Q9BQ70 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCF25Q9BQ70 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TCF25Q9BQ70 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCF25Q9BQ70 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCF25Q9BQ70 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCF25Q9BQ70 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCF25Q9BQ70 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TCF25Q9BQ70 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCF25Q9BQ70 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCF25Q9BQ70 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCF25Q9BQ70 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCF25Q9BQ70 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCF25Q9BQ70 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCF25Q9BQ70 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TCF25Q9BQ70 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCF25Q9BQ70 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCF25Q9BQ70 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCF25Q9BQ70 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCF25Q9BQ70 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TCF25Q9BQ70 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCF25Q9BQ70 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TCF25Q9BQ70 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCF25Q9BQ70 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCF25Q9BQ70 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCF25Q9BQ70 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCF25Q9BQ70 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCF25Q9BQ70 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCF25Q9BQ70 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TCF25Q9BQ70 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TCF25Q9BQ70 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TCF25Q9BQ70 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TCF25Q9BQ70 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCF25Q9BQ70 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCF25Q9BQ70 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCF25Q9BQ70 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCF25Q9BQ70 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCF25Q9BQ70 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCF25Q9BQ70 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCF25Q9BQ70 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCF25Q9BQ70 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCF25Q9BQ70 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCF25Q9BQ70 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCF25Q9BQ70 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCF25Q9BQ70 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCF25Q9BQ70 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCF25Q9BQ70 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCF25Q9BQ70 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCF25Q9BQ70 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCF25Q9BQ70 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCF25Q9BQ70 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCF25Q9BQ70 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCF25Q9BQ70 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCF25Q9BQ70 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCF25Q9BQ70 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCF25Q9BQ70 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCF25Q9BQ70 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCF25Q9BQ70 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TCF25Q9BQ70 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCF25Q9BQ70 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCF25Q9BQ70 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TCF25Q9BQ70 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCF25Q9BQ70 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCF25Q9BQ70 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCF25Q9BQ70 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCF25Q9BQ70 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCF25Q9BQ70 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCF25Q9BQ70 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCF25Q9BQ70 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCF25Q9BQ70 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCF25Q9BQ70 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCF25Q9BQ70 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCF25Q9BQ70 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCF25Q9BQ70 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCF25Q9BQ70 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCF25Q9BQ70 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TCF25Q9BQ70 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCF25Q9BQ70 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TCF25Q9BQ70 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCF25Q9BQ70 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCF25Q9BQ70 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCF25Q9BQ70 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCF25Q9BQ70 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TCF25Q9BQ70 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCF25Q9BQ70 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms