Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DUSP9Q99956 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DUSP9Q99956 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DUSP9Q99956 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
DUSP9Q99956 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
DUSP9Q99956 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
DUSP9Q99956 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DUSP9Q99956 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
DUSP9Q99956 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DUSP9Q99956 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DUSP9Q99956 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DUSP9Q99956 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DUSP9Q99956 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DUSP9Q99956 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DUSP9Q99956 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DUSP9Q99956 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DUSP9Q99956 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DUSP9Q99956 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DUSP9Q99956 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DUSP9Q99956 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DUSP9Q99956 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DUSP9Q99956 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
DUSP9Q99956 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DUSP9Q99956 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DUSP9Q99956 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DUSP9Q99956 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DUSP9Q99956 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DUSP9Q99956 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DUSP9Q99956 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DUSP9Q99956 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DUSP9Q99956 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DUSP9Q99956 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
DUSP9Q99956 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DUSP9Q99956 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DUSP9Q99956 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DUSP9Q99956 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DUSP9Q99956 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
DUSP9Q99956 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DUSP9Q99956 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DUSP9Q99956 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DUSP9Q99956 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DUSP9Q99956 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DUSP9Q99956 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DUSP9Q99956 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DUSP9Q99956 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DUSP9Q99956 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DUSP9Q99956 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DUSP9Q99956 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DUSP9Q99956 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DUSP9Q99956 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DUSP9Q99956 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DUSP9Q99956 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DUSP9Q99956 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DUSP9Q99956 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DUSP9Q99956 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DUSP9Q99956 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DUSP9Q99956 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DUSP9Q99956 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DUSP9Q99956 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DUSP9Q99956 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DUSP9Q99956 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DUSP9Q99956 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DUSP9Q99956 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DUSP9Q99956 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DUSP9Q99956 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DUSP9Q99956 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DUSP9Q99956 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DUSP9Q99956 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DUSP9Q99956 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DUSP9Q99956 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DUSP9Q99956 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DUSP9Q99956 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DUSP9Q99956 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DUSP9Q99956 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DUSP9Q99956 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DUSP9Q99956 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DUSP9Q99956 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DUSP9Q99956 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DUSP9Q99956 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
DUSP9Q99956 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DUSP9Q99956 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DUSP9Q99956 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DUSP9Q99956 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DUSP9Q99956 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DUSP9Q99956 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DUSP9Q99956 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DUSP9Q99956 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DUSP9Q99956 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DUSP9Q99956 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DUSP9Q99956 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DUSP9Q99956 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DUSP9Q99956 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DUSP9Q99956 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DUSP9Q99956 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DUSP9Q99956 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DUSP9Q99956 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DUSP9Q99956 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DUSP9Q99956 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DUSP9Q99956 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
DUSP9Q99956 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms