Protein–RNA interactions for Protein: Q96SQ7

ATOH8, Protein atonal homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATOH8Q96SQ7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATOH8Q96SQ7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATOH8Q96SQ7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATOH8Q96SQ7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATOH8Q96SQ7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATOH8Q96SQ7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATOH8Q96SQ7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATOH8Q96SQ7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATOH8Q96SQ7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATOH8Q96SQ7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATOH8Q96SQ7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATOH8Q96SQ7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATOH8Q96SQ7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATOH8Q96SQ7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATOH8Q96SQ7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATOH8Q96SQ7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATOH8Q96SQ7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATOH8Q96SQ7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATOH8Q96SQ7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATOH8Q96SQ7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATOH8Q96SQ7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATOH8Q96SQ7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATOH8Q96SQ7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATOH8Q96SQ7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATOH8Q96SQ7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATOH8Q96SQ7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATOH8Q96SQ7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATOH8Q96SQ7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATOH8Q96SQ7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATOH8Q96SQ7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATOH8Q96SQ7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATOH8Q96SQ7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATOH8Q96SQ7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATOH8Q96SQ7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATOH8Q96SQ7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATOH8Q96SQ7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATOH8Q96SQ7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATOH8Q96SQ7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATOH8Q96SQ7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATOH8Q96SQ7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATOH8Q96SQ7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATOH8Q96SQ7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATOH8Q96SQ7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATOH8Q96SQ7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATOH8Q96SQ7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATOH8Q96SQ7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATOH8Q96SQ7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATOH8Q96SQ7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATOH8Q96SQ7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATOH8Q96SQ7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATOH8Q96SQ7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATOH8Q96SQ7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATOH8Q96SQ7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATOH8Q96SQ7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATOH8Q96SQ7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATOH8Q96SQ7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATOH8Q96SQ7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATOH8Q96SQ7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATOH8Q96SQ7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATOH8Q96SQ7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATOH8Q96SQ7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATOH8Q96SQ7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATOH8Q96SQ7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATOH8Q96SQ7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATOH8Q96SQ7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATOH8Q96SQ7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATOH8Q96SQ7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATOH8Q96SQ7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATOH8Q96SQ7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATOH8Q96SQ7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATOH8Q96SQ7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATOH8Q96SQ7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATOH8Q96SQ7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATOH8Q96SQ7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATOH8Q96SQ7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATOH8Q96SQ7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATOH8Q96SQ7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATOH8Q96SQ7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATOH8Q96SQ7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATOH8Q96SQ7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATOH8Q96SQ7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATOH8Q96SQ7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATOH8Q96SQ7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATOH8Q96SQ7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATOH8Q96SQ7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATOH8Q96SQ7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATOH8Q96SQ7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATOH8Q96SQ7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
ATOH8Q96SQ7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATOH8Q96SQ7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATOH8Q96SQ7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATOH8Q96SQ7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATOH8Q96SQ7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATOH8Q96SQ7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATOH8Q96SQ7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATOH8Q96SQ7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATOH8Q96SQ7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATOH8Q96SQ7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATOH8Q96SQ7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATOH8Q96SQ7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms