Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALS2CR12Q96Q35 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALS2CR12Q96Q35 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALS2CR12Q96Q35 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALS2CR12Q96Q35 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALS2CR12Q96Q35 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALS2CR12Q96Q35 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALS2CR12Q96Q35 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALS2CR12Q96Q35 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALS2CR12Q96Q35 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALS2CR12Q96Q35 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALS2CR12Q96Q35 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALS2CR12Q96Q35 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALS2CR12Q96Q35 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALS2CR12Q96Q35 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ALS2CR12Q96Q35 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALS2CR12Q96Q35 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALS2CR12Q96Q35 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALS2CR12Q96Q35 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALS2CR12Q96Q35 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALS2CR12Q96Q35 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALS2CR12Q96Q35 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALS2CR12Q96Q35 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALS2CR12Q96Q35 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALS2CR12Q96Q35 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALS2CR12Q96Q35 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALS2CR12Q96Q35 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALS2CR12Q96Q35 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ALS2CR12Q96Q35 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALS2CR12Q96Q35 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALS2CR12Q96Q35 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALS2CR12Q96Q35 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALS2CR12Q96Q35 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALS2CR12Q96Q35 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALS2CR12Q96Q35 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALS2CR12Q96Q35 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALS2CR12Q96Q35 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALS2CR12Q96Q35 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALS2CR12Q96Q35 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALS2CR12Q96Q35 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALS2CR12Q96Q35 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALS2CR12Q96Q35 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALS2CR12Q96Q35 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALS2CR12Q96Q35 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALS2CR12Q96Q35 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALS2CR12Q96Q35 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ALS2CR12Q96Q35 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALS2CR12Q96Q35 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALS2CR12Q96Q35 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALS2CR12Q96Q35 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALS2CR12Q96Q35 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALS2CR12Q96Q35 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALS2CR12Q96Q35 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALS2CR12Q96Q35 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALS2CR12Q96Q35 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALS2CR12Q96Q35 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALS2CR12Q96Q35 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALS2CR12Q96Q35 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALS2CR12Q96Q35 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALS2CR12Q96Q35 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALS2CR12Q96Q35 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALS2CR12Q96Q35 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALS2CR12Q96Q35 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALS2CR12Q96Q35 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALS2CR12Q96Q35 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALS2CR12Q96Q35 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALS2CR12Q96Q35 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALS2CR12Q96Q35 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALS2CR12Q96Q35 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALS2CR12Q96Q35 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALS2CR12Q96Q35 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALS2CR12Q96Q35 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALS2CR12Q96Q35 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALS2CR12Q96Q35 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALS2CR12Q96Q35 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALS2CR12Q96Q35 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALS2CR12Q96Q35 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALS2CR12Q96Q35 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALS2CR12Q96Q35 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALS2CR12Q96Q35 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALS2CR12Q96Q35 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALS2CR12Q96Q35 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALS2CR12Q96Q35 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALS2CR12Q96Q35 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALS2CR12Q96Q35 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALS2CR12Q96Q35 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ALS2CR12Q96Q35 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALS2CR12Q96Q35 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALS2CR12Q96Q35 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALS2CR12Q96Q35 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ALS2CR12Q96Q35 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALS2CR12Q96Q35 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALS2CR12Q96Q35 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALS2CR12Q96Q35 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALS2CR12Q96Q35 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALS2CR12Q96Q35 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALS2CR12Q96Q35 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALS2CR12Q96Q35 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALS2CR12Q96Q35 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALS2CR12Q96Q35 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms