Protein–RNA interactions for Protein: Q96PW8

CSPG4P5, Putative uncharacterized protein KIAA1920, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG4P5Q96PW8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSPG4P5Q96PW8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSPG4P5Q96PW8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CSPG4P5Q96PW8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CSPG4P5Q96PW8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CSPG4P5Q96PW8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSPG4P5Q96PW8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSPG4P5Q96PW8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CSPG4P5Q96PW8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSPG4P5Q96PW8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSPG4P5Q96PW8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSPG4P5Q96PW8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSPG4P5Q96PW8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSPG4P5Q96PW8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSPG4P5Q96PW8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CSPG4P5Q96PW8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CSPG4P5Q96PW8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSPG4P5Q96PW8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSPG4P5Q96PW8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSPG4P5Q96PW8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSPG4P5Q96PW8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSPG4P5Q96PW8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CSPG4P5Q96PW8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSPG4P5Q96PW8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSPG4P5Q96PW8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSPG4P5Q96PW8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSPG4P5Q96PW8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSPG4P5Q96PW8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSPG4P5Q96PW8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSPG4P5Q96PW8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSPG4P5Q96PW8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSPG4P5Q96PW8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSPG4P5Q96PW8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSPG4P5Q96PW8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSPG4P5Q96PW8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSPG4P5Q96PW8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSPG4P5Q96PW8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSPG4P5Q96PW8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSPG4P5Q96PW8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSPG4P5Q96PW8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSPG4P5Q96PW8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSPG4P5Q96PW8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSPG4P5Q96PW8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSPG4P5Q96PW8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSPG4P5Q96PW8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSPG4P5Q96PW8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSPG4P5Q96PW8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSPG4P5Q96PW8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSPG4P5Q96PW8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSPG4P5Q96PW8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSPG4P5Q96PW8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSPG4P5Q96PW8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSPG4P5Q96PW8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSPG4P5Q96PW8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSPG4P5Q96PW8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSPG4P5Q96PW8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSPG4P5Q96PW8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSPG4P5Q96PW8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CSPG4P5Q96PW8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CSPG4P5Q96PW8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSPG4P5Q96PW8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSPG4P5Q96PW8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSPG4P5Q96PW8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSPG4P5Q96PW8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSPG4P5Q96PW8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSPG4P5Q96PW8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSPG4P5Q96PW8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSPG4P5Q96PW8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSPG4P5Q96PW8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CSPG4P5Q96PW8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CSPG4P5Q96PW8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CSPG4P5Q96PW8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSPG4P5Q96PW8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSPG4P5Q96PW8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSPG4P5Q96PW8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSPG4P5Q96PW8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSPG4P5Q96PW8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSPG4P5Q96PW8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSPG4P5Q96PW8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSPG4P5Q96PW8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSPG4P5Q96PW8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSPG4P5Q96PW8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSPG4P5Q96PW8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSPG4P5Q96PW8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSPG4P5Q96PW8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSPG4P5Q96PW8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CSPG4P5Q96PW8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSPG4P5Q96PW8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSPG4P5Q96PW8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSPG4P5Q96PW8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSPG4P5Q96PW8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSPG4P5Q96PW8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSPG4P5Q96PW8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSPG4P5Q96PW8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSPG4P5Q96PW8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSPG4P5Q96PW8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSPG4P5Q96PW8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSPG4P5Q96PW8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSPG4P5Q96PW8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CSPG4P5Q96PW8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms