Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE7

MCEE, Methylmalonyl-CoA epimerase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCEEQ96PE7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCEEQ96PE7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCEEQ96PE7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCEEQ96PE7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MCEEQ96PE7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCEEQ96PE7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCEEQ96PE7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCEEQ96PE7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCEEQ96PE7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCEEQ96PE7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCEEQ96PE7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCEEQ96PE7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCEEQ96PE7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCEEQ96PE7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCEEQ96PE7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCEEQ96PE7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCEEQ96PE7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCEEQ96PE7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCEEQ96PE7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCEEQ96PE7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCEEQ96PE7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MCEEQ96PE7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCEEQ96PE7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MCEEQ96PE7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCEEQ96PE7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCEEQ96PE7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCEEQ96PE7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCEEQ96PE7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCEEQ96PE7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCEEQ96PE7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCEEQ96PE7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCEEQ96PE7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCEEQ96PE7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCEEQ96PE7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCEEQ96PE7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCEEQ96PE7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCEEQ96PE7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MCEEQ96PE7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCEEQ96PE7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCEEQ96PE7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCEEQ96PE7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCEEQ96PE7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCEEQ96PE7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCEEQ96PE7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCEEQ96PE7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCEEQ96PE7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MCEEQ96PE7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCEEQ96PE7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MCEEQ96PE7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCEEQ96PE7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCEEQ96PE7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCEEQ96PE7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCEEQ96PE7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCEEQ96PE7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCEEQ96PE7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCEEQ96PE7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCEEQ96PE7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCEEQ96PE7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCEEQ96PE7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCEEQ96PE7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCEEQ96PE7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCEEQ96PE7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCEEQ96PE7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCEEQ96PE7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCEEQ96PE7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCEEQ96PE7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCEEQ96PE7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCEEQ96PE7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCEEQ96PE7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCEEQ96PE7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCEEQ96PE7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCEEQ96PE7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCEEQ96PE7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MCEEQ96PE7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCEEQ96PE7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCEEQ96PE7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCEEQ96PE7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCEEQ96PE7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MCEEQ96PE7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCEEQ96PE7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCEEQ96PE7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCEEQ96PE7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MCEEQ96PE7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MCEEQ96PE7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCEEQ96PE7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCEEQ96PE7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCEEQ96PE7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCEEQ96PE7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCEEQ96PE7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCEEQ96PE7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCEEQ96PE7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCEEQ96PE7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MCEEQ96PE7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCEEQ96PE7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MCEEQ96PE7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MCEEQ96PE7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCEEQ96PE7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCEEQ96PE7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCEEQ96PE7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCEEQ96PE7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms