Protein–RNA interactions for Protein: Q96NB1

FOPNL, LisH domain-containing protein FOPNL, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOPNLQ96NB1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOPNLQ96NB1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOPNLQ96NB1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOPNLQ96NB1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOPNLQ96NB1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOPNLQ96NB1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FOPNLQ96NB1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FOPNLQ96NB1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FOPNLQ96NB1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOPNLQ96NB1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FOPNLQ96NB1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOPNLQ96NB1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOPNLQ96NB1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOPNLQ96NB1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FOPNLQ96NB1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOPNLQ96NB1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOPNLQ96NB1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOPNLQ96NB1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOPNLQ96NB1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOPNLQ96NB1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOPNLQ96NB1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOPNLQ96NB1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOPNLQ96NB1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOPNLQ96NB1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FOPNLQ96NB1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FOPNLQ96NB1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOPNLQ96NB1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOPNLQ96NB1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOPNLQ96NB1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOPNLQ96NB1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOPNLQ96NB1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOPNLQ96NB1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOPNLQ96NB1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOPNLQ96NB1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOPNLQ96NB1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOPNLQ96NB1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FOPNLQ96NB1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOPNLQ96NB1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOPNLQ96NB1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOPNLQ96NB1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOPNLQ96NB1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOPNLQ96NB1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOPNLQ96NB1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOPNLQ96NB1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOPNLQ96NB1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOPNLQ96NB1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOPNLQ96NB1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOPNLQ96NB1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOPNLQ96NB1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOPNLQ96NB1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOPNLQ96NB1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FOPNLQ96NB1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FOPNLQ96NB1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOPNLQ96NB1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOPNLQ96NB1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FOPNLQ96NB1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOPNLQ96NB1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOPNLQ96NB1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOPNLQ96NB1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOPNLQ96NB1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOPNLQ96NB1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOPNLQ96NB1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FOPNLQ96NB1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOPNLQ96NB1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOPNLQ96NB1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOPNLQ96NB1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOPNLQ96NB1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOPNLQ96NB1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOPNLQ96NB1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOPNLQ96NB1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOPNLQ96NB1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOPNLQ96NB1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOPNLQ96NB1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOPNLQ96NB1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOPNLQ96NB1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOPNLQ96NB1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOPNLQ96NB1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOPNLQ96NB1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FOPNLQ96NB1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOPNLQ96NB1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FOPNLQ96NB1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOPNLQ96NB1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOPNLQ96NB1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOPNLQ96NB1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOPNLQ96NB1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOPNLQ96NB1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOPNLQ96NB1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOPNLQ96NB1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOPNLQ96NB1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOPNLQ96NB1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOPNLQ96NB1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOPNLQ96NB1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOPNLQ96NB1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOPNLQ96NB1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOPNLQ96NB1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOPNLQ96NB1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOPNLQ96NB1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOPNLQ96NB1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOPNLQ96NB1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOPNLQ96NB1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms