Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN9

ZNF488, Zinc finger protein 488, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF488Q96MN9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms