Protein–RNA interactions for Protein: Q96M19

LINC00477, Putative transmembrane protein encoded by LINC00477, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00477Q96M19 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00477Q96M19 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00477Q96M19 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00477Q96M19 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00477Q96M19 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00477Q96M19 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00477Q96M19 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00477Q96M19 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00477Q96M19 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00477Q96M19 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00477Q96M19 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00477Q96M19 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00477Q96M19 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00477Q96M19 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00477Q96M19 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00477Q96M19 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00477Q96M19 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00477Q96M19 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00477Q96M19 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00477Q96M19 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00477Q96M19 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00477Q96M19 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00477Q96M19 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00477Q96M19 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00477Q96M19 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00477Q96M19 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00477Q96M19 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00477Q96M19 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00477Q96M19 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00477Q96M19 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00477Q96M19 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00477Q96M19 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00477Q96M19 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00477Q96M19 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00477Q96M19 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00477Q96M19 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00477Q96M19 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00477Q96M19 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00477Q96M19 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00477Q96M19 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00477Q96M19 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00477Q96M19 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00477Q96M19 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00477Q96M19 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00477Q96M19 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00477Q96M19 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00477Q96M19 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00477Q96M19 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00477Q96M19 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00477Q96M19 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00477Q96M19 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00477Q96M19 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00477Q96M19 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00477Q96M19 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00477Q96M19 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00477Q96M19 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00477Q96M19 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00477Q96M19 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00477Q96M19 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00477Q96M19 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00477Q96M19 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00477Q96M19 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00477Q96M19 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00477Q96M19 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00477Q96M19 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00477Q96M19 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00477Q96M19 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00477Q96M19 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00477Q96M19 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00477Q96M19 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00477Q96M19 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00477Q96M19 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00477Q96M19 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00477Q96M19 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00477Q96M19 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00477Q96M19 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00477Q96M19 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00477Q96M19 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00477Q96M19 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00477Q96M19 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00477Q96M19 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00477Q96M19 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00477Q96M19 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00477Q96M19 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms