Protein–RNA interactions for Protein: Q96KH6

C18orf12, Uncharacterized protein C18orf12, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf12Q96KH6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C18orf12Q96KH6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C18orf12Q96KH6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
C18orf12Q96KH6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C18orf12Q96KH6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C18orf12Q96KH6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C18orf12Q96KH6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C18orf12Q96KH6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C18orf12Q96KH6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C18orf12Q96KH6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C18orf12Q96KH6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
C18orf12Q96KH6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C18orf12Q96KH6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
C18orf12Q96KH6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C18orf12Q96KH6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C18orf12Q96KH6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
C18orf12Q96KH6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C18orf12Q96KH6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C18orf12Q96KH6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C18orf12Q96KH6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C18orf12Q96KH6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C18orf12Q96KH6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C18orf12Q96KH6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C18orf12Q96KH6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C18orf12Q96KH6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C18orf12Q96KH6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C18orf12Q96KH6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C18orf12Q96KH6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C18orf12Q96KH6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C18orf12Q96KH6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C18orf12Q96KH6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
C18orf12Q96KH6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C18orf12Q96KH6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C18orf12Q96KH6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C18orf12Q96KH6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C18orf12Q96KH6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
C18orf12Q96KH6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C18orf12Q96KH6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C18orf12Q96KH6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C18orf12Q96KH6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C18orf12Q96KH6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C18orf12Q96KH6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C18orf12Q96KH6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C18orf12Q96KH6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
C18orf12Q96KH6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C18orf12Q96KH6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C18orf12Q96KH6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C18orf12Q96KH6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C18orf12Q96KH6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C18orf12Q96KH6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C18orf12Q96KH6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C18orf12Q96KH6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C18orf12Q96KH6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C18orf12Q96KH6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C18orf12Q96KH6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C18orf12Q96KH6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C18orf12Q96KH6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C18orf12Q96KH6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C18orf12Q96KH6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C18orf12Q96KH6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C18orf12Q96KH6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C18orf12Q96KH6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
C18orf12Q96KH6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C18orf12Q96KH6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C18orf12Q96KH6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
C18orf12Q96KH6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C18orf12Q96KH6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C18orf12Q96KH6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C18orf12Q96KH6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C18orf12Q96KH6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C18orf12Q96KH6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C18orf12Q96KH6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C18orf12Q96KH6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C18orf12Q96KH6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C18orf12Q96KH6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C18orf12Q96KH6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C18orf12Q96KH6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
C18orf12Q96KH6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C18orf12Q96KH6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C18orf12Q96KH6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C18orf12Q96KH6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C18orf12Q96KH6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C18orf12Q96KH6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C18orf12Q96KH6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
C18orf12Q96KH6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
C18orf12Q96KH6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C18orf12Q96KH6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C18orf12Q96KH6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C18orf12Q96KH6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C18orf12Q96KH6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C18orf12Q96KH6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C18orf12Q96KH6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C18orf12Q96KH6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C18orf12Q96KH6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
C18orf12Q96KH6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
C18orf12Q96KH6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C18orf12Q96KH6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
C18orf12Q96KH6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
C18orf12Q96KH6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
C18orf12Q96KH6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms