Protein–RNA interactions for Protein: Q96IS3

RAX2, Retina and anterior neural fold homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX2Q96IS3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAX2Q96IS3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms