Protein–RNA interactions for Protein: Q96HE9

PRR11, Proline-rich protein 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR11Q96HE9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRR11Q96HE9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRR11Q96HE9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRR11Q96HE9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PRR11Q96HE9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRR11Q96HE9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRR11Q96HE9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRR11Q96HE9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRR11Q96HE9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRR11Q96HE9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRR11Q96HE9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRR11Q96HE9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRR11Q96HE9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRR11Q96HE9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PRR11Q96HE9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PRR11Q96HE9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRR11Q96HE9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRR11Q96HE9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRR11Q96HE9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRR11Q96HE9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRR11Q96HE9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRR11Q96HE9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRR11Q96HE9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRR11Q96HE9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRR11Q96HE9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRR11Q96HE9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRR11Q96HE9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRR11Q96HE9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRR11Q96HE9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRR11Q96HE9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRR11Q96HE9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRR11Q96HE9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRR11Q96HE9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRR11Q96HE9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRR11Q96HE9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRR11Q96HE9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRR11Q96HE9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRR11Q96HE9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PRR11Q96HE9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PRR11Q96HE9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PRR11Q96HE9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRR11Q96HE9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRR11Q96HE9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRR11Q96HE9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRR11Q96HE9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRR11Q96HE9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRR11Q96HE9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRR11Q96HE9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRR11Q96HE9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRR11Q96HE9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRR11Q96HE9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRR11Q96HE9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRR11Q96HE9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRR11Q96HE9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRR11Q96HE9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRR11Q96HE9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRR11Q96HE9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRR11Q96HE9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRR11Q96HE9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRR11Q96HE9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRR11Q96HE9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRR11Q96HE9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRR11Q96HE9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRR11Q96HE9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRR11Q96HE9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRR11Q96HE9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRR11Q96HE9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRR11Q96HE9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRR11Q96HE9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRR11Q96HE9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRR11Q96HE9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRR11Q96HE9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRR11Q96HE9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRR11Q96HE9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRR11Q96HE9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRR11Q96HE9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRR11Q96HE9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PRR11Q96HE9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PRR11Q96HE9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRR11Q96HE9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRR11Q96HE9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRR11Q96HE9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRR11Q96HE9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRR11Q96HE9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRR11Q96HE9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRR11Q96HE9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRR11Q96HE9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRR11Q96HE9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRR11Q96HE9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRR11Q96HE9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRR11Q96HE9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRR11Q96HE9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRR11Q96HE9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRR11Q96HE9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRR11Q96HE9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRR11Q96HE9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRR11Q96HE9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PRR11Q96HE9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRR11Q96HE9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRR11Q96HE9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms