Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTP4Q96DX8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTP4Q96DX8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTP4Q96DX8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTP4Q96DX8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTP4Q96DX8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTP4Q96DX8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RTP4Q96DX8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTP4Q96DX8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTP4Q96DX8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTP4Q96DX8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTP4Q96DX8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTP4Q96DX8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTP4Q96DX8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RTP4Q96DX8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RTP4Q96DX8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RTP4Q96DX8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RTP4Q96DX8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RTP4Q96DX8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RTP4Q96DX8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RTP4Q96DX8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RTP4Q96DX8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RTP4Q96DX8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RTP4Q96DX8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RTP4Q96DX8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTP4Q96DX8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTP4Q96DX8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTP4Q96DX8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTP4Q96DX8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTP4Q96DX8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTP4Q96DX8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTP4Q96DX8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTP4Q96DX8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTP4Q96DX8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RTP4Q96DX8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTP4Q96DX8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTP4Q96DX8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RTP4Q96DX8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RTP4Q96DX8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTP4Q96DX8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTP4Q96DX8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RTP4Q96DX8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTP4Q96DX8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTP4Q96DX8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTP4Q96DX8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTP4Q96DX8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTP4Q96DX8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTP4Q96DX8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTP4Q96DX8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTP4Q96DX8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RTP4Q96DX8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RTP4Q96DX8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RTP4Q96DX8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RTP4Q96DX8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RTP4Q96DX8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RTP4Q96DX8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RTP4Q96DX8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RTP4Q96DX8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RTP4Q96DX8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RTP4Q96DX8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RTP4Q96DX8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RTP4Q96DX8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RTP4Q96DX8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RTP4Q96DX8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RTP4Q96DX8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RTP4Q96DX8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RTP4Q96DX8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RTP4Q96DX8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RTP4Q96DX8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RTP4Q96DX8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RTP4Q96DX8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RTP4Q96DX8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RTP4Q96DX8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RTP4Q96DX8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RTP4Q96DX8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RTP4Q96DX8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RTP4Q96DX8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RTP4Q96DX8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RTP4Q96DX8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RTP4Q96DX8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RTP4Q96DX8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RTP4Q96DX8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RTP4Q96DX8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RTP4Q96DX8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RTP4Q96DX8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RTP4Q96DX8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RTP4Q96DX8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RTP4Q96DX8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RTP4Q96DX8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RTP4Q96DX8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RTP4Q96DX8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RTP4Q96DX8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RTP4Q96DX8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RTP4Q96DX8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RTP4Q96DX8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RTP4Q96DX8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RTP4Q96DX8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RTP4Q96DX8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RTP4Q96DX8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RTP4Q96DX8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms