Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C18orf8Q96DM3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C18orf8Q96DM3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C18orf8Q96DM3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C18orf8Q96DM3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
C18orf8Q96DM3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C18orf8Q96DM3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C18orf8Q96DM3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C18orf8Q96DM3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C18orf8Q96DM3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C18orf8Q96DM3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C18orf8Q96DM3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C18orf8Q96DM3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C18orf8Q96DM3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C18orf8Q96DM3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C18orf8Q96DM3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C18orf8Q96DM3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C18orf8Q96DM3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C18orf8Q96DM3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C18orf8Q96DM3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C18orf8Q96DM3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
C18orf8Q96DM3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
C18orf8Q96DM3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C18orf8Q96DM3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C18orf8Q96DM3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C18orf8Q96DM3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C18orf8Q96DM3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C18orf8Q96DM3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C18orf8Q96DM3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C18orf8Q96DM3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C18orf8Q96DM3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C18orf8Q96DM3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C18orf8Q96DM3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C18orf8Q96DM3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C18orf8Q96DM3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C18orf8Q96DM3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C18orf8Q96DM3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
C18orf8Q96DM3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C18orf8Q96DM3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C18orf8Q96DM3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C18orf8Q96DM3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C18orf8Q96DM3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
C18orf8Q96DM3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C18orf8Q96DM3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C18orf8Q96DM3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C18orf8Q96DM3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C18orf8Q96DM3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C18orf8Q96DM3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C18orf8Q96DM3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C18orf8Q96DM3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C18orf8Q96DM3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C18orf8Q96DM3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C18orf8Q96DM3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C18orf8Q96DM3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C18orf8Q96DM3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C18orf8Q96DM3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C18orf8Q96DM3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C18orf8Q96DM3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C18orf8Q96DM3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C18orf8Q96DM3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C18orf8Q96DM3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C18orf8Q96DM3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C18orf8Q96DM3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C18orf8Q96DM3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C18orf8Q96DM3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C18orf8Q96DM3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C18orf8Q96DM3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C18orf8Q96DM3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C18orf8Q96DM3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C18orf8Q96DM3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C18orf8Q96DM3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C18orf8Q96DM3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C18orf8Q96DM3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C18orf8Q96DM3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C18orf8Q96DM3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C18orf8Q96DM3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C18orf8Q96DM3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C18orf8Q96DM3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C18orf8Q96DM3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C18orf8Q96DM3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C18orf8Q96DM3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C18orf8Q96DM3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C18orf8Q96DM3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C18orf8Q96DM3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C18orf8Q96DM3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C18orf8Q96DM3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
C18orf8Q96DM3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C18orf8Q96DM3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C18orf8Q96DM3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C18orf8Q96DM3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C18orf8Q96DM3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C18orf8Q96DM3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C18orf8Q96DM3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C18orf8Q96DM3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C18orf8Q96DM3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C18orf8Q96DM3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
C18orf8Q96DM3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
C18orf8Q96DM3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C18orf8Q96DM3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C18orf8Q96DM3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms