Protein–RNA interactions for Protein: Q96C92

SDCCAG3, Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3Q96C92 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDCCAG3Q96C92 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDCCAG3Q96C92 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDCCAG3Q96C92 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDCCAG3Q96C92 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDCCAG3Q96C92 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDCCAG3Q96C92 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDCCAG3Q96C92 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDCCAG3Q96C92 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDCCAG3Q96C92 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDCCAG3Q96C92 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDCCAG3Q96C92 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDCCAG3Q96C92 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDCCAG3Q96C92 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDCCAG3Q96C92 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDCCAG3Q96C92 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDCCAG3Q96C92 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDCCAG3Q96C92 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDCCAG3Q96C92 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDCCAG3Q96C92 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDCCAG3Q96C92 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDCCAG3Q96C92 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDCCAG3Q96C92 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SDCCAG3Q96C92 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDCCAG3Q96C92 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDCCAG3Q96C92 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDCCAG3Q96C92 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDCCAG3Q96C92 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDCCAG3Q96C92 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDCCAG3Q96C92 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDCCAG3Q96C92 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDCCAG3Q96C92 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDCCAG3Q96C92 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDCCAG3Q96C92 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDCCAG3Q96C92 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDCCAG3Q96C92 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDCCAG3Q96C92 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDCCAG3Q96C92 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDCCAG3Q96C92 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDCCAG3Q96C92 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDCCAG3Q96C92 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDCCAG3Q96C92 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDCCAG3Q96C92 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SDCCAG3Q96C92 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDCCAG3Q96C92 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDCCAG3Q96C92 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDCCAG3Q96C92 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDCCAG3Q96C92 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms